《紅巖》的故事情節如下：1948年，在黨的統治下處在黎明前最黑暗的時刻。為了配合工人運動，重慶地下黨工運書記許雲峰命甫志高建立沙坪書店，作為地下黨的備用聯絡站。甫志高為了表現自己，不顧聯絡站的保密性質，擅自擴大書店規模，銷售進步書刊。
一天，區委書記江姐要去華鎣山根據地，甫志高到碼頭為江姐送行，江姐囑咐他要注意隱蔽，他嘴上答應，心裡卻不以為然。江姐到離根據地不遠的一座縣城時，發現自己的丈夫、華鎣山縱隊政委彭松濤的人頭被高掛城頭。見到縱隊司令員“雙槍老太婆”後，她強忍悲痛，堅決要求到丈夫生前戰鬥的地方工作。甫志高又自作主張吸收一名叫鄭克昌的青年入店工作，許雲峰知道情況後大吃一驚，幾經分析發現鄭克昌行跡可疑，便讓甫志高通知所有人員迅速轉移。
甫志高卻根本不聽勸告，反認為許雲峰嫉妒自己的`工作成績，結果被捕併成了可恥的叛徒。由於他的告密，許雲峰、成崗、餘新江和劉思揚等人很快相繼被捕。特務頭子徐鵬飛得意忘形，妄圖藉此將重慶地下黨一網打盡。然而，他使盡各種伎倆，都沒能從許雲峰等人身上得到任何所需的東西。凶殘的敵人為了得到口供，瘋狂地折磨政治犯。他們給犯人食用黴爛的食物，而且在炎熱的夏天限制飲水數量，妄圖用炎熱、蚊蟲、飢餓和乾渴動搖革命者的意志。
為了粉碎敵人的陰謀，獄中難友乘放風時在牆角挖出一眼泉水，在保護泉水的鬥爭中，龍光華英勇犧牲，全獄難友絕食抗議敵人的暴行，敵人不得不妥協讓步。