醫學專業是德國工業中的強勢專案，製藥業的營業額在德國工業營業額中排名第二，拜爾醫藥企業列歐洲醫藥企業的第4位。海德堡大學設有馬普協會的醫學研究所德國癌症研究中心等科研機構。其研究成果在世界上都享有一定聲譽。其醫學總系下有各類專業和系。這裡培養出了兩位諾貝爾醫學獎得主，阿爾布萊希特·考索爾(AlbrechtKossel)，在蛋白質和核酸研究中取得巨大成果，獲19xx年諾貝爾生理學醫學獎;奧托·弗裡茨·麥耶豪夫(AttoFritzMeyerhof)，研究生物反應鏈取得成果，獲19xx年諾貝爾生理學醫學獎。
柏林自由大學擁有德國最重要的醫學培訓中心，每年都有成千上萬的人在柏大接受治療。科隆大學的治療教育系(HeilpaedagogischeFakultaet)是全世界最大的特種治療系，基爾大學在醫學研究領域，基爾大學醫院對骨盆腔檢查的器械和外科手術的發展，以及對世界範圍內的`最少感染外科手術的發展具有決定性的影響。波鴻魯爾大學德國研究協會的萊普尼茨獎授予了這個大學的醫學系。神經學它被公認的強項。