自動化工程學院始創於1956年，前身為成都電訊工程學院無線電測量專業和1959年成立的自動控制專業。2001年9月，以自動化係為主體，與高能物理電子研究所相關專業進行調整組合，改建為自動化工程學院。目前，學院擁有“儀器科學與技術”博士後流動站，“測試計量技術與儀器”、“檢測技術與自動化裝置”兩個博士點，“測試計量技術與儀器”、“檢測技術與自動化裝置”、“模式識別與智慧系統”、“控制理論與控制工程”、“地圖製圖學與地理資訊工程”等5個碩士點，以及“測控技術與儀器”、“自動化”、“電力系統自動化”、“環境工程”等4個本科專業，專業領域覆蓋“儀器科學與技術”、“控制科學與工程”、“測繪科學與技術”等三個一級學科。其中測試計量技術及儀器為四川省重點學科，現代測試技術實驗室為四川省重點實驗室，在電子測試技術與儀器教育部工程研究中心1個。
學院擁有一批包括中國科學院院士在內的、學術造詣很深的全國知名專家、學者。自動化工程學院的“電子測量”、“自動測試技術”和“介面技術”的教學、科研工作，在全國處於領先水平。50多年來為國家培養了近萬名各類畢業生，湧現了以李小文院士為代表的一批傑出人才；形成了“電子測試技術與儀器”、“複雜電子系統綜合測試診斷與預測”、“智慧資訊控制與處理”、“自動化檢測”、“電力自動化”等優勢學科方向，成為我國軍用電子儀器的重要研製力量和測試工業的技術源頭。
學院發展的長期目標是：以人才培養為中心，以學科建設為龍頭，把自動化工程學院建設成為在測試和控制專業領域國內領先、國際先進的創新人才培養基地和科學研究基地。充分發揮學科面寬的優勢，積極響應國家需求、推進學科交叉，使學院成為高新技術和新興學科的源頭。
——學科建設
學院擁有一個博士後流動站（儀器科學與技術）；兩個博士點學科（測試計量技術及儀器、檢測技術與自動化裝置）；五個碩士點學科（模式識別與智慧系統、控制理論與控制工程、檢測技術與自動化裝置、地圖製圖學與地理資訊工程、測試計量技術及儀器），其中測試計量技術及儀器1999年被批准為四川省重點學科；四個本科專業（環境工程、自動化、電力系統自動化、測控技術及儀器），其中測控技術及儀器和自動化為四川省品牌專業。
近五年來，學院學科建設取得了長足的進步和飛速的發展，通過“十五”，“211”和“985”工程以及學校“傑出人才”等專案的建設，學院建成了“多域多引數綜合測試與資訊處理”、“VLSI測試生成理論與技術”，“微波遙感基地”，“電力自動化實驗室”和“應用超導與電工技術研究中心實驗室”等6個學科平臺，其中“985”工程建成的“微波遙感基地”為我院的學科方向—現代微波與通訊測試理論及技術走向成熟奠定了堅實的基礎，同時李小文院士的引進為我院的微波測試方向拓展了微波遙感測試與環境監測方面的研究。學院不但在已有的學科建設中取得了豐碩的成果，還有一些相關的研究領域如“可穿戴計算”，“無線感測網路”等也在我院得到了良好的發展。
——科學研究
長期以來，學院形成了電子測試技術和儀器，複雜電子系統綜合測試，智慧資訊控制與處理，自動化檢測系統，神經網路計算智慧等數十個相輔相成且特色鮮明的研究方向。在軍事電子測量與儀器、複雜系統綜合測試與診斷等方向上處於國內領先地位，依託我院測試計量技術及儀器學科組建的“電子科技大學測試技術與儀器研究所”，目前是總裝備部定點的軍用測試儀器“一所（電子41所）、一廠（前鋒集團）、一校（電子科大）”三大骨幹承製單位之一。近十年承擔軍事預研和型號專案30餘項，完成了“二次雷達內場綜合測試系統及系列測試儀器模組”等20多項填補國內空白、打破國外壟斷的技術成果，在我國武器裝備的維護保障中發揮了不可替代的作用。同時我院在國家十五研究中形成了一系列的科學研究成果。如ES4521行動式邏輯分析儀獲國防科技進步二等獎。400MHz/102通道邏輯分析儀獲國防科技進步“二等獎”微波洩露監測儀獲國家發明專利。二次雷達綜合測試系統獲2005教育部提名國家科技進步獎。
