電氣工程學院歷史悠久，其辦學歷史可追溯到1923年成立的國立東南大學電機系。從中央大學、南京工學院、到今天的東南大學都一直設有電氣工程相關學科和專業。曾經有大批國內外學術界知名的專家、學者在學院工作，如：吳玉麟、陳章、吳大榕、程式、楊簡初、嚴一士、閔華、周鶚、陳珩等。
電氣工程學院現設有電氣工程一級學科博士學位授權點，含電機與電器、電力系統及其自動化、電力電子與電力傳動、高電壓與絕緣技術、電工理論與新技術、應用電子與運動控制、電氣資訊科技和新能源技術等二級學科，其中，電機與電器、電力系統及其自動化兩個二級學科為江蘇省重點學科。設有電氣工程博士後流動站和電氣工程及其自動化本科專業。電氣工程學院是國家“211工程”、“985工程”一期、二期的重點建設單位，是教育部電氣工程及其自動化專業教學指導分委員副主任單位。電氣工程及其自動化本科專業是江蘇省高等學校品牌專業，2006年6月又首個通過教育部工程教育專業認證。
目前，電氣工程學院有專任教師50餘人，其中教授22人(含博士生導師19人)，副教授和高階工程師20人。專任教師中有博士學位的教師佔70%，另有在職攻讀博士學位的教師8人。博士後流動站博士後研究人員10人。有兼職院士1名、長江學者1名、國家傑出青年基金獲得者2名、省級優秀骨幹教師4名，省“333工程培養物件”2名，省“六大人才高峰”學術帶頭人2人，省“青藍工程學術帶頭人”2名，國家教育部優秀骨幹教師1名，享受國務院“政府特殊津貼”的有12名。
電氣工程學院堅持本科生教育與研究生教育並重、教學與科研並重的方針，在不斷加強本科生教育的同時，積極開展研究生培養和科學研究，每年招收碩士研究生和博士研究生130多名。近五年來承擔了國家“863”高技術專案、國家自然科學基金專案、以及省部級專案數50餘項，取得一批達到了國內外領先水平的重要研究成果。獲得14項國家和省部級獎項、30餘項國家專利、另有數十項成果通過了省部級鑑定，發表論文700餘篇（其中三大檢索300篇），出版學術專著8部。
近年來，電氣工程學院積極開教學改革和研究，承擔了國家、省和學校各類教改專案數十項，取得了一批教學成果，獲得國家級教學成果獎2項、國家級優秀教材1項，省部級精品教材獎2項，出版“十五”和“十一五”國家級規劃教材等15部。
學院擁有Rockwell自動化實驗室、電力電子實驗室、電機實驗室、微特電機實驗室、電力系統模擬實驗室、計算機實驗室等裝置先進的實驗室。近年新建了伺服控制技術教育部工程研究中心、南京市電氣裝置與自動化工程技術中心、東南大學－香港德昌電機聯合研究中心、東南大學電力需求側管理研究所、東大－中電聯合研發中心、東大—金智聯合研發中心、東大—南自通華電力電子研究中心、東南大學風力發電研究中心等，強化了科研與經濟建設的結合。
電氣工程學院與境外數十所知名高校和研究機構建立了穩定的合作關係，如亞琛工業大學（德）、蘇黎士工業大學（瑞士）、謝菲爾德大學（英）、俄亥俄州立大學（美）、巴士（BATH）大學（英）、倫敦城市大學（英）、斯德萊克德大學（英）、伊阿華州立大學（美）、愛知工業大學（日）、莫納什（Monash）大學（澳大利亞）、悉尼理工大學（澳大利亞）、香港大學和香港理工大學等，每年都互派學者講學，交換留學生，開展聯合科研等。每年亦邀請多位國際知名專家來校講學、進行研究生聯合培養等。另外，每年都派出10多位教師和研究生參加各類國際學術會議。2005年成功舉辦了大型國際學術會議“第八屆國際電機與系統會議”，2008年又成功舉辦了DRPT08國際學術會議，提高了學院電氣工程學科在國內外的影響和學術地位。
