《黃帝內經》與《易經》、《山海經》並稱中國古代的三大奇書，給後人留下了團團迷霧，至今仍神祕莫測。
縱觀中國古代醫學史，從無解剖學這門學科。《黃帝內經》不但清晰描述了人體的解剖結構，而且對人體生理學、人體病理學、醫學地理學、醫學物候學等學科做了精闢描述。《黃帝內經》的很多論述，人們至今只知道其結果是正確的，當代人類科學還不能做出科學解釋。因此，有人認為《黃帝內經》與《易經》一樣，其著述者有著比現代人更加先進的思想和科學技術，是大聖大智之人。
《黃帝內經》對中國文化的最大貢獻，要數其陰陽五行學說，他不但影響了整個中國文化，也對世界現代科學觀念產生了巨大影響。中國至今沿用的預測學，除來自《易經》外，很大部分均來自《黃帝內經》的陰陽五行學說。《黃帝內經》一直是陰陽五行學說的經典著作。
《黃帝內經》是中醫的鼻祖，也是一部預測學的'書，他告訴人們順應自然法則，如何養生和避免災禍。“從金木水火土的衰旺生克，可以推知疾病的輕重，治療的成敗，確定五臟之氣的盛衰，疾病的險夷，死生的日期”。如肝主春木之氣，如果一個人日干為甲乙，肝必旺盛，一生就不會患肝上的毛病。若病在肝臟，到夏天就會痊癒；如果夏天好不了，到秋天就會加重；如果不死，冬天病情就會呈執持狀態；次年春天，肝逢春木本氣，病情就會緩解，如此迴圈往復。
《黃帝內經》“上窮天紀，下極地理，選取諸物，近取諸身，更相問難”，天地萬物無所不包，涉及哲學、天文、地理、氣象、兵法、社會、曆法、陰陽等各個學科，其中的醫學理論迄今才被西方醫學論及，而且比西方醫學更加高明。
《黃帝內經》是大聖大智之人的著作。《黃帝內經》的成書年代說法頗多。據考證，《黃帝內經》成書於科技、文化、教育極其落後的上古時代，那個時代的人們還過著刀耕火種的日子，怎麼會對天文、地理、氣象、社會、曆法、陰陽等學科有如此深刻的認識，即使科技、文化、教育高度發達的今天，也無人能出其右。難怪宋人高保衡曾感嘆，人之髒肺、脈象、經絡、氣血，是不能入眼從體外和解剖得知的，若非大聖大智之人，又如何能夠探知呢。