注意順序和結構
SCI論文寫作的第一步就是組織羅列計劃展示的資訊。有些人善於從寫提綱開始，有些人則直接開始寫作，在SCI論文寫作的過程中發現和組織重要的資訊點。無論選擇哪種方式，都要注意到科技寫作對順序和結構的特定要求。
研究論文、評述或(基金)申請書的每部分有固定的內部結構，例如：引言部分包括研究主題的已有成果或背景知識、要解決的未知或存在問題的領域、本研究的總體目的和實驗方法的大體描述。由此引出的主題提綱為：
A. Known/Background
1. General
2. Specific reported data
B. Unknown/Problem
C. Research purpose/Question
D. Experimental approach
如果決定寫一個更詳細的提綱，可以加入新的想法和所收集研究過的材料。提綱可寫成句子的.形式，並記錄文獻來源以備日後之用。例如：
Question:
To determine how changing CO2concentrations affect flowering plants
A. Background:
1. General: Influence ofclimate change
(a)Gas composition of air in past (Liu and Froschauer 1, p.80; Dohler et al.,2005)
(b) Gas composition ofair has changed due to increasing temperature of atmosphere (Peters et al.,1990)
i. O2concentration has decreased due to climate change (Joh et al., 1999)
ii. CO2concentration has increased due to climate change (Kim et al., 2000)
2. Specific reported data: Changing O2and CO2 concentration affects plant populations (Honeck et al.,2003)
(a) Maple fertilitydecreases with decreasing O2 concentration (Weinberger &Shewitz, 2000a)
(b) Maize growth rate andsize increases with increasing CO2 concentrations (Herbert et al.,2002)
B. Unknown/Problem:
Not known how increasing CO2 concentrations affectthe growth of flowering plants
C. ResearchPurpose/Question:
To determine how changingCO2 concentrations affect flowering plants
D. ExperimentalApproach:
We observed and evaluatedthe growth rate and size of six different flowering plant species under variousCO2 concentrations.
組織資料和想法
有些研究人員認為收集完所有資料後方可動筆，有些人認為隨時都可以開始。無論使用哪個方案，基本的前提是必須已經積累了足夠的資料和想法。
在實驗室的膝上型電腦裡要條理清晰地記錄實驗日誌和參考文獻，包括材料來源、實驗方法、原始資料和衍生資料等，這會有很大幫助。
收集了足夠的資料後，將其設計為好的圖表對一篇研究論文來說極其重要：把所有必要資訊都放入圖表以便提供充實的資訊。
資料整理或文獻閱讀過程中，隨時記下任何新的想法，把這些想法用大綱形式寫下來是一個行之有效的方法(對大綱進行調整完善以便更好地表達這些想法)。
當提綱中的各個條目被細分為相應的主題，就可以把這些內容寫成段落的形式了。如果有需要，在任何階段都不要害怕新增或刪除提綱裡的內容。
根據收集的資料和資訊完成段落的寫作之後，把寫好的段落依據原有的提綱排列。有時候，會發現自己要重新調整提綱，這沒有關係，可以一直調整，直到段落的順序符合邏輯性，以保證段落與段落之間自然的過渡與銜接。