鈣在十二指腸吸收，是在活性D3調節下的主動吸收，腸管的pH可明顯的影響鈣的吸收，偏鹼時減少鈣的吸收，偏酸時促進吸收。食物中草酸和植酸可以和鈣形成不溶性鹽，影響吸收。鈣通過腸管和腎排洩，由消化道排除的鈣包括未吸收的和由腸管分泌的。每日由腎小球濾過鈣約10g，但由尿中排出的僅約l50mg，所以大部均由各段腎小管回吸收了。尿鈣排出量直接受血鈣濃度影響，血鈣低於2.4mmol/L時，尿中幾無鈣排出。
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日常生活中，如果鈣攝入不足，人體就會出現生理性鈣透支，造成血鈣水平下降。當血鈣水平下降到一定閾值時，就會促使甲狀旁腺分泌甲狀旁腺素。甲狀旁腺素具有破骨作用，即將骨骼中的鈣反抽調出來，藉以維持血鈣水平。在缺鈣初期，缺鈣程度比較輕的時候，只是發生可逆性生理功能異常，如心臟出現室性早博、情緒不穩定、睡眠質量下降等反應。持續的低血鈣，特別是中年以後，人體長期處於負鈣平衡狀態，導致甲狀旁腺分泌亢進，首當其衝的是骨骼，由於骨鈣持續大量釋出，導致骨質疏鬆和骨質增生。另一方面，在甲狀旁腺持續升高的情況下，由於甲狀旁腺素具有促使細胞膜上鈣通道開啟而關不住，以及阻抑鈣泵，使鈣泵功能減弱，造成細胞內鈣含量升高。持續的細胞內高鈣，激發細胞像失控的野馬，無節制亢進，造成細胞能量耗竭。與此同時，代謝廢物又得不到及時消除，便會構成自身傷害，致使細胞趨向反常的鈣化衰亡。由於缺鈣，導致骨質疏鬆、骨質增生、兒童佝僂病、手足抽搐症以及高血壓、腎結石、結腸癌、老年痴呆等疾病的發生。
鈣可以控制心率和血壓，也參與肌肉的收縮活動。沒有這種物質，我們的身體就不能自如活動，這也解釋了為什麼缺鈣的人就想整天躺在床上。所以如果由於缺鈣感到疲倦，可以吃點意式芝士，酸奶或牛奶。這些都是高鈣食品。不過，疲倦僅僅是缺鈣的一種表現。失眠、高血壓、經前抽筋、怕冷，甚至感到過度緊張也可能是缺鈣的標誌，因為鈣能幫助調節神經系統。
有很多日常可得的食物能幫我們補充鈣質、強健骨骼。例如芹菜、油菜、雪裡蕻，羊肉和雞肉，以及各種魚蝦類水產品和大部分乾果等。
現代醫學研究證明，缺鈣會造成人體生理障礙，進而引發一系列嚴重疾病。這裡列舉一些與缺鈣有關的主要疾病：
高血壓：缺鈣會造成反常的鈣內流，導致鈣在血管內壁細胞和平滑肌細胞內反常積貯，引起血管收縮，血管外周阻力增大，血壓異常升高。持續的鈣內流，促使血管壁彈性纖維和內皮細胞鈣化、變性、甚至出現襲痕、斷裂。外周阻力進一步增大，血壓持續升高。由於血管內壁損傷，脂類通透性增大，血脂浸入血管壁的損傷處，造成膽固醇和其他脂類物質在血管壁上沉積。血管內皮細胞內損傷而分泌內皮素和某些啟用因子，引起血小板和白血球在血管壁上粘附、聚集。血管內皮細胞的損傷，又啟用補償性生理反應，促使血管平滑肌和成纖維細胞反常增生和內膜下移位，致使動脈管壁增厚、變硬，於是層層疊疊、大大小小的動脈粥樣硬化形成了。研究表明，對於某些高血壓病人來說，不用藥物而是增加鈣製劑的量，有助於控制高血壓。
冠心病：許多研究表明，鈣還能降低血中膽固醇的濃度，從而起到保護心臟的作用。有人觀察，讓膽固醇含量較高的男子食用含鈣量低的食物10天(每天410毫克鈣)，檢查他們膽固醇含量;然後再讓他們吃含鈣量高的食物(每天2200毫克鈣)。結果高鈣食物能減少膽固醇總量6%，其中低密度脂蛋白減少11%，而對人體有益的高密度脂蛋白數量則保持不變。專家認為，長時期嚴重缺鈣會引發冠心病。
尿路結石：醫生告訴腎結石病人限制食用鈣，理由是鈣為結石的一種主要成分。但是，美國哈佛大學的醫學專家經過多年研究後發現，這可能是人類在認識上的一個大錯誤。他們提出，減少腎結石危險的方法恰恰是增加鈣攝入量。大家知道，飲食中，特別是蔬菜中含有大量草酸鹽，一般情況下，草酸鹽在腸道內與鈣結合成草酸鈣隨糞便排出。如果飲食中鈣的攝入不足，就會使多餘草酸鹽經腸腔吸收而進入血液，最終由腎臟提出。如果人體長期處於負鈣平衡狀態，腎臟細胞不可避免會出現細胞反常鈣內流損傷，腎臟回吸收功能減退，尿鈣排出增多。高鈣尿液與尿中草酸鹽結合，形成大大小小草酸鈣結石。如果不忌鈣，而是採取補鈣措施，尤其是補充水溶性鈣劑，那麼，在胃腸道中與飲食中草酸鹽結合成草酸鈣隨糞便排出。另外，補充足量的鈣可扭轉負鈣平衡，腎臟回吸收功能正常，尿鈣排出減少，結石的可能性也減少。
結(直)腸癌：高脂飲食會過度刺激膽汁的分泌，過量的脂肪酸和膽汁酸是引起結(直)腸細胞癌變的觸發劑。有研究證明，患有結腸直腸癌的病人，血清膽汁酸的含量比正常人高出1倍左右，而癌變細胞中膽汁酸含量比正常細胞高3倍以上。如果用高膽汁酸的飼料喂小白鼠，結(直)腸癌的.發生率明顯增加。如果補充足量的碳酸鈣，鈣離子與脂肪酸和膽汁酸結合，形成不溶性脂肪酸鈣和膽汁酸鈣隨糞便排出，從而消除癌變的觸發因子，就能阻抑腸細胞癌變。
鈣與肌肉收縮：人體有著健美的身姿和自如的運動能力，這是因為有骨骼肌的興奮。骨骼肌的興奮是由鈣起著中心作用的，鈣離子在肌肉細胞中的濃度變化，調節骨骼肌肉的收縮與興奮，即使是人們從人體外表看不見的平滑肌和心肌，也是在鈣離子的作用下發生著各種的生理反應。鈣像一個指揮官，指揮著全身內外的肌肉運動。在肌肉收縮過程中，當神經纖維接受刺激後，鈣離子流入細胞內，此時肌肉中的鈣離子濃度是肌肉收縮的基本條件。肌漿網是肌肉中鈣的主要儲存處，而且是最高度發育的鈣運輸系統，當骨骼肌受到刺激後，肌漿網中大量的鈣將釋放出來，細胞外的鈣離子進入細胞內，細胞液中的鈣離子濃度增加產生肌肉收縮，然後又是在鈣泵作用下使肌肉內鈣離子排出到細胞外產生肌肉舒張，整個過程迅速而短暫。如果鈣在肌肉中的平衡狀態遭到破壞，便會引起骨骼肌的疼痛、抽搐以及功能的下降，也會引起體內所有平滑肌和心肌的不正常運動，使人體喪失靈巧和控制自己運動的平衡和協調機能。
手足搐搦症：這種疾病是因嬰幼兒體內缺少維生素D而使腸道對鈣、磷的吸收發生障礙。另外由於甲狀旁腺未能及時分泌更多甲狀旁腺素，以致血鈣降低，引起神經肌肉的興奮性增高，出現全身驚厥、手足痙攣和喉痙攣，常伴發陣發性呼吸暫停和短時間窒息，引起缺血缺氧性腦損傷。據醫學觀察，大腦神經對缺血缺氧最為敏感，窒息10秒鐘，神經功能開始出現障礙;窒息數分鐘，就會出現血管神經不可逆轉的損傷，輕則影響孩子智力，重則導致低能、痴呆。所以，做好手足搐搦症的預防工作是十分重要的，不管是母乳餵養還是人工餵養的孩子，都必須補充足夠量的鈣。除了補鈣外，還要增加戶外活動，多晒太陽和補充適量維生素D，以預防手足搐搦症的發生。維生素D是鈣離子被骨髓吸收的載體，鈣之緣片加入了維生素D，使人體對鈣離子吸收能成倍增加。
骨質疏鬆：人體長期缺鈣而引起負鈣平衡的另一個嚴重後果——骨質疏鬆。很多研究表明，增加鈣的攝入量對骨質損耗有著重要減緩作用，在減少由骨質疏鬆引起的骨折率方面也有著重要作用，特別在食用鈣的同時服用維生素D，效果尤其明顯。很多專家認為，補鈣應在青春期就開始，這時候骨質正在形成，效果會更好。
隨著平均期望壽命延長，老年人越來越多，骨質疏鬆的危害將會越來越突出。
骨質疏鬆症早期往往沒有症狀和體徵，X線檢查又不易發現，所以長期來不被人們注意。即使病情加重，主要表現是骨痛和骨質增生，常常不被醫生所認識，往往錯診為腰肌勞損，或是關節炎。隨著病情加重，骨量丟失到骨峰值的30%——50%時，骨骼變脆，稍有不慎就可造成骨折。據報告，上海市老年人骨折累計發生率，城市高達16.5%，農村6.9%。這種骨折往往又難癒合，常因久臥不起，併發褥瘡或墜積性肺炎，嚴重者甚至會因此而喪生。