做醫藥招商的企業很多，但是真正能夠發展良好，運營長久的卻是鳳毛麟角。仔細查詢原因，主要問題還在於企業的管理方式中，而且經資料統計，80%的企業都存在著相似的弊病，總的來說，主要有四大方面。
領導事事親為 不肯放權
在企業的人治的管理情況下，大多企業的醫藥招商高層管理者獨攬了太多的權利，中層處於“執行多、權利少”的狀態，由於沒有明確得到授權，很多企業的中層就抱著“少幹少犯錯”的原則，消極對待工作。
缺乏明確的權責劃分
與缺乏授權的缺陷相反，在醫藥招商企業的一些關鍵崗位上，企業的所有者對自己信任的人（多為所有者的親屬）過於信任，沒有職責分離意識。職責分離是指遵循不相容職務相分離的原則，實現合理的組織分工。
所謂不相容職務，是指那些如果由一個人擔任，既可能弄虛作假，又能夠掩蓋其作弊行為的職務，不相容職務分離就是要求把不相容職務由不同的醫藥人員擔任。
內部審計鬆懈
很多企業缺乏嚴格的醫藥預算體系，預算管理流於形式，產品成本核算粗放，難以實現有效的成本控制；資金管理沒有明確的計劃性，對資金有效使用效率的評估與考核不夠；同時還缺乏內部審計制度。
內部審計既是內部控制的一個組成部分，又是內部控制的一種特殊形式。內部審計是在組織內部對各種經濟活動、管理制度是否合規合理及有效所進行的獨立評價，以確定既定的政策和程式是否貫徹，建立的標準是否遵循，醫藥招商資源的利用是否合理有效，以及單位的目標是否達到。
缺乏內部審計制度，會使醫藥企業的資金使用和各種活動處於非常隨意的狀態。
缺乏資訊記錄
適當的資訊記錄是醫藥招商企業內部控制的'重要方面，它既是其他控制有效性的保證，又是企業保持高效率經營和高質量資訊的手段。但可惜目前中國很多本土的製藥企業缺乏對這項工作的重視，有些企業連最基本的產品流向都缺乏記錄，因此企業的很多決策都是盲目的。
在這種管理制度下，一名或一組僱員的工作必須與其他僱員的工作相一致或與其他僱員的工作相聯絡，以便互相監督。例如一個醫藥招商企業的授權、簽發、核准、執行、記錄工作，不應該由一個人擔任。