儘管案例研究性質是實證研究，但作為一篇MBA學位論文，學員還是應當儘可能地體現出應有的學術水平。從這個意義上講，案例研究類的學位論文不同於在課堂上應用的案例討論或案例研究。
總體上講，可供參考的研究思路，首先應該尋找基礎理論與所研究案例的結合點。也就是說，要明確論文的研究背景、文體、意義和方向。在此前提下，學員可以充分收集案例研究物件的相關資料，越詳細越好。在佔有和消化資料的基礎上，學員可以運用一定的研究框架或方法，對研究物件進行系統的分析，結合相關理論知識或工作經驗，得出一些啟發性的結論或建議，並將之整理成文。
此外，學員還可以按以下思路撰寫此類論文：案例的背景分析、問題分析、解決問題的方法、措施分析、相關結論分析、案例的啟示性意義分析等。
一篇規範的案例研究類MBA學位論文，其基本的研究內容（研究意義與理論文獻，案例基本情況介紹，對案例的例析，結論和建議）。
第一，研究意義與理論文獻。MBA學員應在這部分介紹與將要研究的案例相關研究背景、研究問題、研究目的與意義及基礎文獻，為後文將要分析的案例奠定基礎。理論分析可以以文獻回顧的方式或以研究重點總結的方式進行，然後可以對此做出評論並進而提出自己的傾向性觀點或理論模式，以此為參照可以對案例加以分析和研究。
第二，案例基本情況介紹。案例研究與理論研究不同，案例的情況千差萬別，熟悉某一理論的讀者或論文評閱人並不一定知道學生將要研究的案例中涉及的企業或事件。所以_,在這部分應當把研究物件的基本情況和相關資訊、資料進行較客觀、較詳細的介紹，以使讀者或論文評閱人對論文的研究物件有一個初步的瞭解。
第三，對案例的剖析。在這部分，應依據理論設計或相關知識，有層次、有重點地對案例中的某些或部分問題進行專門的分析和論述。研究過程可以按流程的順序展開，也可以按所涉及的'問題的類別展開，視MBA學員對案例材料的掌握和對理論分析的程度而定。這是論文的核心部分，MBA學員應綜合運用相關知識，在案例所給定的條件限制下，進行相應的分析。這在很大程度上是對MHA學員的基本功和綜合能力的考驗。
第四，結論與建議。案例研究的最終結論應當基於案例，但又不完全拘泥於案例。在對案例進行系統的分析和研究後，MBA學員應當結合相關理論知識或實踐經驗，把在案例分析過程中得到的啟發或“火花”以啟示、結論或建議的形式表述出來，並整理成文。這也是案例研究的最終“落腳點”.沒有結論和建議的案例分析，可以說是一篇不完整的案例研究論文。