分類表/主題詞表作為傳統的知識組織工具與本體具有相似性，即它們都是以提高檢索效率和創用CC為目的;都用來描述特定領域的學科知識，都可以用作特定學科的知識組織工具;兩者都包含詞(概念、類)及詞(概念、類)間關係;兩者都具有等級結構，並通過等級關係及詞(概念、類)間關係將詞(概念、類)組織起來。
然而Ontology與這些傳統知識組織工具有著本質的區別。Ontology中概念之間的關係的表達比分類表/主題表等工具要廣而且深。本體更強調對具體事物屬性和關係的描述，強調構建領域概念的形式化模型，重視術語體系的模型化、明晰化、形式化和概念模型的共享性。
分類表、主題詞表的詞間關係精確程度不高，無法揭示更深更廣的語義關係。並且它們沒有自身的知識表示語言、無法實現形式化編碼，無法支援知識資源的知識標註和知識檢索。一個完善的Ontology能夠提出結構的主體概念的關係，包括superclassPsubclassPinstance(超類亞類飛例項)關係、property value(特徵值)、時間關係以及依賴於所用的表達語言的關係等。通常一個Ontology包含的不止是關係，與分類表、主題詞相比這些關係被正式地定義並不模糊。Ontology用基於描述邏輯的知識表示語言對概念體系(類、關係、函式、公理、例項)進行形式化描述，能支援本體標引工具對資源進行語義標註，支援以知識網路的方式展示知識結構。因此，Ontology對概念的揭示程度遠遠高於分類表飛主題詞表。
本體( Ontology)在數字圖書館知識組織中的作用
1.規範描述知識間的語義關係運用本體方法對數字圖書館的知識進行組織，可以減少概念和術語上的歧義，概念間的關係可以被描述得更加廣泛、詳細、深入和全面，通過對概念新增屬性值，對屬性與屬性之間再新增對映關係，一些在正規詞表中不能描述的語義關係就可以清晰的描述出來。本體描述為數字圖書館提供了一個統一框架或規範模型，使得來自不同背景，持不同觀點和目的的人們之間的理解和交流成為可能，並保持語義上的一致性。
2.實現知識重用和共享本體概念體現的是共同認可的知識。這如同美國哲學家托馬斯·庫恩提出的被某一科學共同體所公認的"正規化"。可以說，本體概念體系是一種公約。由於本體反映的是相關領域中公認的概念，所以數字圖書館通過本體對相關知識領域的知識進行規範化描述和識別，可以達成領域內關於知識和概念及概念關係之間的共識，實現各學科領域本體之間(如法學本體、經濟學本體等)的共享和複用。
3.實現知識檢索在本體的'支撐下實現基於語義的知識檢索，這是本體的重要應用之o知識檢索是知識組織的逆過程。實現基於概念語義的知識檢索，就必須以本體作為組織領域知識的語義模型，實現對資源的語義標註，形成機器可理解的語義元資料，以基於本體的知識語言標示、檢索領域知識。只有以基於本體的知識組織模式為基礎以各領域本體的概念模型作為資源元資料的規範描述標準，才能真正實現數圖書館中基於語義的知識檢索。