一、新形勢下基層衛生院強化藥品成本核算的方法
（一）加強對基層衛生院藥品預算管理
樹立全面預算的管理理念，加強對醫院藥品在預算管理，如結合年度藥品採購計劃，編制藥品預算方案，並對年末的各項藥品發生額與預算進行比較，從而改進藥品的預算管理目標。同時，對預算內容上，要結合醫院資金的管理，包括對藥品收支預算和參與藥品招投標進行管理，還包括對非基本醫療藥物採購的會計管理。對涉及到往來賬款要進行有效的預算，如對當前藥品成本佔醫院總經營成本的比例，如果比例過大，給醫院的資金管理帶來隱患，從而影響了醫院的各項業務開展。
（二）加強對基層衛生院的內部會計控制制度的改革
內部會計控制制度的建立，有利於企業對於各類經濟活動都實現了有效的監督。新形勢下，基層衛生院雖然實現了基本醫療藥品零差價，仍有必要通過建立內部會計控制制度，以實現對藥品的成本核算。具體來講，內部會計管理制度，能夠實現對各類藥品進行準確的核算，並通過對內部會計人員的監督機制，運用財務管理的方法和程式，從價值上來實現有效的成本效率控制。主要從以下幾點來著手，一是從責任的落實上，做好財務核算人員的職責分工，並結合定期的成本核算狀況進行總結和分析，從彙集的財務資訊中選擇科學的方法來確保藥品成本效率核算的時效性和針對性。二是從行政監督上來確保藥品成本核算制度有效實施，作為基層醫療衛生服務機構，必須要從自我評估中來加強對藥品成本的的監督和評價，及時發現藥品成本核算中的問題和漏洞，結合新情況和新問題，積極採取措施加以修正和改進。
（三）加強對藥品採購流程過程的成本核算控制
從概念上講，藥品的採購成本主要是從藥品的採購到入庫整個過程中的一切費用，而實施基本藥品零差價銷售以來，藥品主要是在上級主管部門的主導下統一指標採購，更是從藥品的採購渠道上進行了全面的分類彙總核算，以實現對各類藥品的明確分類，並結合其藥品價格進行明確，以便於實現對藥品成本進行科學、合理的核算。同時，在對於藥品銷售商的管理中，對於部分集中採購藥品而進行的打折等情況，要通過對其進行準確的計算，從財務科目上增加折扣科目，以便於對醫院藥品採購中發生現金折扣的藥品進行單獨核算。需要說明的是，對於藥品折扣，作為藥品成本核算管理的重要內容，需要基層醫療會計人員能夠切實將核算工作做到實處。
（四）從藥品的儲存和領取過程中加強成本核算控制
在藥品的儲存和領取過程中，由於藥品在庫房之間的流動，從而產生一定的費用成本，而在藥品成本核算工作中，必須要考慮到這一因素，並能夠從加強對藥品庫房的對賬管理來確保藥品成本的一致性。需要說明的是，對於藥品在售價上的調整，需要結合藥品管理實際進行核算，並且不能違背基本醫療藥物的零差價原則，並與藥品物價監管部門進行及時的協調，切實從藥品的成本核算控制中來提高基層醫療衛生院的管理能力和水平。
（五）加強對基層醫療衛生機構的會計審計監督控制
建立會計審計制度，從各基層醫療衛生院的會計工作實際來強化監督，如在實施內部管理控制的條件下，通過對各項資產物資的管理監督、交接記錄的分析，以及相關藥品物價執行情況的檢查等，以實現對各基層醫療衛生院會計工作的.績效考核，從而提升基層會計工作效率和質量。
（六）加強對財務管理人員綜合素質的培訓和提升
在做好基層醫療衛生院藥品成本核算工作的前提，必須依靠高素質的會計隊伍。為此，從財務管理資訊化的應用上，來不斷加強對成本核算人員的培訓，通過繼續教育，業務技能培訓，來提高會計人員的糾錯和防錯能力，避免會計資訊失真，使其既要滿足“核算型”的要求，又要適應“科技型”的需要。同時加強職業道德建設，切實提高基層醫療衛生院的會計人員的綜合素養和能力，以滿足專業技能和業務素質全面提升的綜合人才隊伍的形成。
二、總結
總之，作為公益性的基層醫療衛生院，必須能夠從過去的依靠藥品單價來維持生存的工作態度中轉變過來，將提升醫療服務水平，改進醫療服務質量，切實通過制度監督來完善基層醫療衛生服務機構的藥品成本核算機制。同時，在新醫院會計制度下，更應該從日常醫療衛生管理服務過程中，通過不斷改進藥品成本核算方法，執行好基本醫療藥物零差價的惠民政策，以最低的花銷為社群居民提供最滿意的醫療服務。