畢業論文要表明作者己經掌握了中醫藥學科的基礎理論、專業知識和基本技能，能綜合運用本專業知識分析、解決問題，具有從事中醫藥技術和研究工作的初步能力。這種論文涉及的課題難度並不太大，畢業論文與學位（士）論文不完全等同。學位論文（包括學士、碩士和博士三級）。是學位申請者為了獲得學位而撰寫，用於答辯的學術論文，學位論文是考核學位申請者能否獲得學位的重要依據。中醫畢業論文是由高等院校中醫專業畢業生（本科、研究生）撰寫，是培養高層次中醫藥人才的重要方面。寫畢業論文的目的是為了讓學生把課堂學到的各種知識，通過論文寫作得以加工融合，而轉化成為發現問題、解決問題的能力，畢業論文的寫作是一個獨立，不可替代的重要的學習環節。
我國1980年頒佈的學位條例，規定高等學校本科畢業生課程成績優良，學士學位論文成績優良，達到一定學術水平即可授予學士學位，目前國內醫學教育界尚未設立獨立的學士學位論文，一般認為，撰寫學士學位論文應具備以下要求：
1）掌握了中醫藥學科的基礎理論和系統的專業知識。
2）具有從事中醫藥研究工作或擔負專門技術工作的能力。
3）對研究課題有新的見解（體會）。
論文格式是由論文內容決定的，中醫論文總體上屬於自然科學論文的範疇。撰寫格式要遵循國家和國際標準和規定，國家標準是《GB7713—86科學技術報告、學位論文和學術論文的編寫格式》，國際標準是《ISO8—1977文獻工作—期刊的編排格式》。作者要隨時關注有關期刊對中醫論文寫作格式的最新要求。根據現行的有關標準，中醫論文寫作的基本格式應包括以下部分：題目、摘要、導言、正文（臨床資料、材料方法）討論、小結、致謝、參考文獻。
學位論文因學位級別、專業型別的不同，其結構略有差異。但基本結構是由標題、署名、目錄、摘要、關鍵詞、正文（引言、資料、結論）討論、致謝、參考文獻組成。學位論文屬於學術論文的範疇，具備學術論文的一般特徵，是一種重要的中醫藥論文文體，但它又是一類非常特殊的學術論文，其鮮明的個性特點表現在：
1、作者單一：學士學位論文是由大學本科畢業生獨立完成，並以此考察申請人的知識基礎和動手能力，（碩士、博士學位的論文是研究生，或未經過研究生階段的學習，在中醫藥研究上做出優異成績的同等學歷者）。
2、篇幅不限：由於學位論文要顯示作者已經掌握了堅實的基礎理論、系統的專門知識，相應的工作能力。論文要體現一定的工作量，故論文篇幅不受限制，但不宜太短（5000——10000字）。
3、用於申請學位：學術論文是用於傳遞學術資訊、進行學術交流，多為公開發表、或會議宣讀交流的形式。但學位論文的撰寫目的是用於答辯，申請學位，或向學位授予部門遞交的論文。
4、學位的考核依據：大學本科生或研究生的學業，主要體現在課程的學習情況和論文的寫作水平。全面考核申請學位人員的學術水平，論文是反映知識和能力的重要依據。通過考察論文的質量及答辯成績，決定是否授予學位。