中國醫科大學法醫學院的前身是上世紀二十年代建立的滿州醫科大學法醫學教室，1946年改為國立瀋陽醫學院法醫學科。1948年11月，瀋陽解放後被併入中國醫科大學病理學系法醫學組。1951年，法醫學組受東北人民政府司法部委託，組織法醫培訓班，進行法醫學教學，同時為我校40期學生開設了《法醫學》課程。1952年9月，正式成立法醫學教研室，隸屬基礎醫學部，承擔本校各專業學生的《法醫學》課程教學。1954年，陳東啟、賈靜濤教授參加了衛生部組織的高等醫學院校用《法醫學教學大綱》的制訂工作。1955年，受衛生部委託承辦了全國第一期法醫師資進修班，為我國醫學院校新組建的法醫學教研室培訓師資22名。自1953年起，在陳東啟教授領導下，組織翻譯了蘇聯著名法醫學家波波夫所著的《法醫學》，於1955年由人民衛生出版社出版，並被衛生部審訂為全國醫學院校試用教材，成為我國首部法醫學專業教材。
1958年，陳東啟教授領導的課題組在我國首次研發併成功抗製備了M、抗N血清，同時發現利用煮沸紅血球進行吸收以提高紅血球的利用率，並在東北、河北、山東等中國北方五個省進行上萬名漢族人群ABO與MN血型分佈的調查，這是我國曆史上最早、規模最大的一次血型普查，所獲得的成果至今仍為法醫學鑑定的重要參考資料。上世紀六十年代初期還開展了利用分泌型人唾液製備高效價“抗A”、“抗B”和“抗H”血清;採用混合凝集反應檢查毛髮血型;在福爾馬林固定臟器中檢出ABO型物質等多項新技術的研發，使專業科研水平有了顯著提高。
1979年，中國醫科大學開始招收法醫專業五年制本科生，是我國第一個招收法醫專業本科生的院校。1981年，受衛生部委託舉辦了第二期法醫師資及法醫師培訓班。1982年，法醫學專業被國務院學位委員會批准為碩士學位授權學科，成為我國首批法醫學專業碩士學位授權學科。1984年，受教育部委託舉辦了第三期法醫師資及法醫師培訓班，為國內各醫學院校開設《法醫學》課程培養專業師資。
1980年3月14日，在賈靜濤倡議下，組織成立了我國第一個地方性法醫學學術團體―瀋陽法醫學會，並出版了學會刊物《法醫通訊》，也是新中國建立以來的第一部法醫學專業學術刊物，為推動我國法醫學領域的研究成果交流和學科發展作出積極的貢獻。
1985年3月18日，學校根據國家教育指導委員會決定，正式建立法醫學系，同時組建六個教研室，包括法醫病理學教研室、法醫血清學教研室、臨床法醫學教研室、法醫人類學教研室、法醫化學教研室和法醫學概論與法律教研室。
1986年7月，經國務院學位委員會批准我校法醫學專業為博士學位授權學科，是國內首批具有博士學位授權的學科之一。
1987年10月，法醫學系在我國首次主辦了國際法醫學術研討會，也是我國曆史上首次舉辦的國際性法醫學學術會議，國內外共有200餘名專家和法醫工作者參加了會議，受到與會者好評。學院已先後派出20餘名教師到日本、美國、英國、澳大利亞等國家講學、考察、進修或攻讀博士學位，並邀請日本、英國、美國、澳大利亞、新加坡等國家的專家學者來學院訪問和講學，進行廣泛的學術交流。
2000年5月，根據法醫學科發展需要，經學校批准成立法醫學院，下設法醫病理學教研室、法醫血清學教研室、法醫臨床學教研室、法醫人類學教研室、法醫毒物分析教研室和基礎法律教研室。目前，學院共有教職員工30人，其中教師22人，教輔及行政管理人員8人。教師中，教授12人，副教授2人，講師7人，助教1人;擁有博士研究生導師8人，碩士研究生導師3人;有博士學位13人(含博士後4人)，碩士學位9人。
長期以來，中國醫科大學不斷加強法醫學專業學科建設，努力提升法醫學教學、科研質量重視培養實用型法醫學專業人才，同時為社會提供法醫學鑑定服務，實現了以教學、科研成果促進學科建設，並服務於專業人才培養和法醫學鑑定的良性迴圈。2006年至2011年，在學校的支援下學院先後獲得財政部與遼寧省共建專案、中央財政支援地方高校專項資金專案等多項教學經費近1000萬元，先後建立了法醫學多媒體解剖室、法醫病理形態學多媒體互動實驗室、法醫電生理實驗室、DNA分析實驗室、死後生化學檢測室、細胞培養與分子生物學實驗室等一批現代化教學與科研實驗室。其中，法醫病理形態學多媒體互動實驗室是目前國內法醫學專業領域中首個準數字化教學平臺。學院先後承擔了教育部、美國中華醫學基金會、遼寧省及校級各類教學課題13項，獲得多項部省級教學成果獎。承擔各類科研課題70項，其中國家自然科學基金課題11項，部省級及市級課題59項，獲得科研經費500餘萬元，在國際及國家級專業核心期刊發表論文800餘篇。作為主編、副主編主持和參加編寫法醫學專著13部、法醫學專業國家級規劃教材11部，參加編寫其他各類教材和著作20餘部。學院十分重視“教學質量工程”建設，近年來取得了豐碩成果：
2006年，法醫學專業被評為遼寧省示範專業;
2006年，《法醫病理學》被評為遼寧省精品課程;
2007年，《法醫物證學》被評為遼寧省精品課程;
2008年，法醫學專業被教育部評為國家級特色專業;
2008年，《法醫物證學》被評為國家級精品課程;
2009年，中國醫科大學法醫學實驗教學中心被評為省級法醫學實驗教學示範中心;
2010年，《法醫病理學》被評為國家級精品課程;
2011年，法醫學專業被評為中國醫科大學重點學科。
學院的雄厚師資力量和良好的教學、科研與司法鑑定條件，為專業人才培養奠定了堅實的基礎。為進一步強化實用型法醫學專業人才的培養，學院在國內多個省份建立了22個法醫學教學實習基地，分佈於東北三省、江蘇省、河南省及廣東省。迄今為止，已培養法醫學專業本科生1073人、碩士研究生185人、博士研究生45人、在職法醫學人才756名，所培養的畢業生受到公、檢、法及科研院所等用人單位的好評。
法醫學鑑定是培養法醫學專業人才中不可缺少的工作。上世紀五十年代，中國醫科大學法醫學教研室已經成為東北地區的法醫學鑑定中心，承擔公、檢、法及衛生行政管理部門委託的各類法醫學鑑定。2003年，經遼寧省司法廳批准註冊成立了面向社會服務的法醫學鑑定機構―“中國醫科大學法醫司法鑑定中心”。每年受理司法機關、仲裁機構和衛生行政部門委託的法醫學鑑定4000餘例。2006年，“遼寧省司法鑑定協會”成立，王保捷教授當選為首屆會長。2008年，“鑑定中心”被司法部確定為國家級法醫司法鑑定培訓基地。2009年和2010年，“鑑定中心”兩次被司法部評選為“全國司法戰線先進集體稱號”。目前，“鑑定中心”擁有具有司法鑑定資質專家23人。工作中恪守“公正、客觀、科學”的理念，鑑定工作在我國享有很高的權威性，為我國司法部門相關案件的偵查、審理、訴訟和審判及衛生行政部門醫療糾紛案件的處理提供了有力的證據，也為我國社會主義法制建設做出了積極的貢獻。