揚州大學醫學院坐落在歷史悠久、人文薈萃、風景秀麗的歷史文化名城揚州城區，辦學歷史悠久、辦學特色鮮明。醫學院的前身可追溯到創立於1950年的蘇北衛生學校。1958年升格為揚州醫學專科學校，1984年經原國家教委批准升格為本科院校，更名為揚州醫學院。1992年與在揚其他5所高校合併組建揚州大學。醫學院是全國首批設定婦產科學專業、率先招收中西醫結合專業、護理學本科專業的醫學院校，也是迄今在全國唯一開設臨床醫學面板性病防治專業方向的醫學院校。醫學院是衛生部性病防治基地，教育部全國職教師資培訓基地(護理學)、司法部監獄管理局罪犯心理諮詢培訓基地、司法部戒毒局戒毒矯治培訓基地，也是江蘇省社群矯正心理諮詢培訓基地、江蘇省養老護理培訓基地，是本地區醫藥人才培養、醫療服務和醫學科學研究中心。
醫學院設有基礎醫學與醫學技術系、臨床醫學系、中西醫結合學系、藥學系和護理學系。擁有省級基礎醫學實驗教學示範中心、中央與地方共建臨床醫學教學實驗中心和藥學綜合教學實驗室。現設有臨床醫學、中西醫結合臨床醫學、護理學、藥學、醫學檢驗技術等5個本科專業，學制5年或4年。臨床醫學專業開設婦產、面板病性病防治、麻醉與重症醫學等輔修方向，護理學專業開設助產護理輔修方向，中西醫結合臨床醫學專業開設鍼灸推拿輔修方向。醫學院也是經教育部批准的可招收來華留學生醫學本科教育(英語授課)的學校。根據最新統計，我院畢業生參加全國臨床執業醫師資格考試，首次考試通過率(80.94%)高於全國平均通過率(62.84)18.1個百分點;護士執業資格考試通過率100%。本科學生畢業一次性學位授予率連續3年在99%以上，學生考研錄取率佔應屆畢業生的42.5%，標誌著我院醫學本科教育質量不斷向高水平、高層次邁進。
在學科建設方面，醫學院現擁有博士學位授權一級學科(中西醫結合)1個，博士後流動站1個。擁有基礎醫學、臨床醫學、中西醫結合、公共衛生與預防醫學、藥學、中藥學、護理學等7個碩士學位授權一級學科以及臨床醫學、中藥學等2個專業碩士學位授權點，覆蓋內、外、婦、兒、護理、藥學、預防等56個二級學科碩士點，是國家第一批臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校。擁有江蘇省一級學科重點學科1個，省級重點實驗室1個，省級臨床重點專科18個，中央財政支援地方高校發展專項資金建設專案1個。基礎醫學、臨床醫學、中藥學為校級一級學科重點學科。擁有省級精品課程(含成人教育)3門，校級精品課程(含成人教育)12門。擁有江蘇省特聘教授、“雙創計劃”、“333高層次人才工程”、“六大人才高峰”、“青藍工程”、“博士集聚計劃”等省級以上高層次醫學科技人才。擁有江蘇省蘇北人民醫院、揚州市第一人民醫院、揚州市中醫院等9所臨床醫學院，還有遍佈省內外30餘所教學實習醫院、2個藥業集團、1個藥品檢驗所為實踐教學基地。現有在讀全日制本科生2050人，全日制博士(後)、碩士研究生392人，6年制臨床醫學專業來華留學生(MBBS)專案284人，從而形成了從本科生、研究生到博士後，從全日制到留學生教育的全方位、多層次的高等醫學教育體系。
醫學院高度重視科研工作，近年來承擔國家自然科學基金專案、國家科技支撐計劃專案等國家級課題100餘項，取得了一大批高水平的科研成果，產生了顯著的社會效益和經濟效益。學院設有《實用臨床醫藥雜誌》編輯部，該雜誌為全國公開發行的核心學術期刊，2004年獲全國科技期刊評比一等獎，連續五屆獲教育部“中國高校優秀期刊獎”。學院現為中國高校科技期刊研究會醫學期刊專業委員會第二屆常務委員會主任委員單位。
醫學院辦學60多年來，始終以培養合格醫藥人才為已任，立足蘇中、服務江蘇、輻射全國，以“求是、求實、求新、求精”的校風和“堅苦自立”的校訓砥礪奮進，乘勢而上，打造出“基礎好、實踐強、吃得苦、用得上、幹得好”的揚醫畢業生品牌，贏得了社會各界的廣泛讚譽。校友遍及海內外，湧現出全國優秀共產黨員、全國勞動模範、“白求恩獎章”獲得者吳登雲等一大批傑出校友，為祖國醫藥衛生事業和社會進步作出了積極的貢獻。