南開大學數學科學學院的前身為南開大學數學系，是由現代數學在我國最早和最有成效的播種人之一的姜立夫先生於1920年創立的，是當時中國大學的第二個數學系(算學系)。抗日戰爭時期，與北京大學數學系、清華大學算學系合組西南聯大算學系(數學系)，1946年覆校返津。1952年全國院校調整，原天津大學數學系合併到南開大學數學系。1960年至1963年曾更名為數學力學系。1983年自動控制專業和計算機軟體從數學系調出，與其它相關專業合組成立計算機與系統科學系。1985年，經教育部批准，由數學大師陳省身教授提議創辦、並親自擔任所長的南開數學研究所(陳省身數學研究所)成立。1997年5月7日， 成立數學科學學院。
數學系(院)建立90多年來，先後有一批傑出的數學家曾在數學系(院)任教，如：嚴志達、王梓坤、柯召、吳大任、胡國定、劉晉年、錢寶琮、申又悵、蔣碩民、孫本旺、鄧漢英、周學光、曾鼎禾、楊宗磐等。培養了以陳省身、江澤涵、吳大任、劉晉年、申又悵、孫本旺等為傑出代表的大批優秀數學人才。
學院擁有基礎數學、概率論與數理統計、應用數學三個二級學科國家重點學科，2007年數學學科為一級學科國家重點學科。擁有數學、統計學一級學科博士學位授予權，並設有數學博士後流動站。學院在基礎數學、計算數學、概率論與數理統計、應用數學和生物資訊學五個二級學科和統計學一級學科招收和培養研究生。
1993年，國家教委批准數學科學學院(系)為國家基礎科學研究與教學人才培養基地，其前身為陳省身先生倡導的於1986年國家批准設立的數學試點班。該基地“培養基礎性數學人才的實踐”2001年獲國家級教學成果一等獎，並被評為天津市特等勞動模範集體，2002年被授予“全國五一勞動獎狀”。2007年“數學文化課程組”被授予“全國五一勞動獎狀”。學院設有數學與應用數學、資訊與計算科學、統計學三個本科專業。
學院現設教學與研究機構：數學系、資訊與概率系、統計學系、應用數學系、科學與工程計算系、數理金融與精算科學系、高等數學教學部、計算實驗室;擁有核心數學與組合數學教育部重點實驗室。1997年12月建立的組合數學研究中心、2003年1月成立的科學計算研究所掛靠數學科學學院。
南開大學數學學科包括數學科學學院、陳省身數學研究所、組合數學研究中心。數學學科現有教師 103人，教授45人、博士生導師39人、具有博士學位的91人。其中，中國科學院院士3人、第三世界科學院院士2人、國際數學化學科學院院士1人、教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授4人、講座教授5人、國家傑出青年基金獲得者5人、香港求是基金會傑出青年學者獎5人、跨世紀人才 4人、教育部新世紀優秀人才支援計劃13人、首批新世紀百千萬人才工程國家級人選1人、國家級“教學名師獎”獲得者1人。多人次是國家科委973專案的分組負責人、參加者，國家自然科學基金重點專案的主持人。此外，我校數學學科還有校特聘講座教授和客座教授多名，已形成了一支年齡結構與學科結構合理、學術造詣高、學術視野寬闊且具有很強團隊協作意識的學術隊伍。
2011年底共有學生968人，其中本科生708人，碩士生249人(專業碩士27人，墨爾本專案21人)，博士生135人(含直博生)。
數學學科在包括《Ann. of Math.》， 《Invent. Math.》， 《Duke Math.J.》， 《Adv. Math.》等重要數學刊物上發表論文多篇。近五年來，共發表研究論文800多篇，其中SCI檢索700多篇。
近年來，數學學科獲得包括國家自然科學獎二等獎(兩項)、第三世界科學院數學獎(兩項)、長江學者成就獎(一項)、中國數學會陳省身數學獎(一項)等在內的重要獎勵16項。另外，在教學方面，南開數學學科共獲國家教學成果一等獎、二等獎各一項及其他省部級教學獎多項，2007-2011年共獲國家基礎科學人才培養科學基金“南開大學數學基地”兩項。本學科歷來十分重視研究生的培養工作，研究生的培養質量不斷得到提高，全國百篇優秀博士論文獎獲得者5人， 全國百篇優秀博士論文提名獎獲得者4人，中國數學會鍾家慶數學獎獲得者7人。
憑藉良好的學科建設基礎，我們更加重視數學的應用研究，特別是在網路安全、產品質量、影象處理等方向的研究。在應用數學方面，我們繼續了代數學與組合學的交叉研究、化學與圖論的交叉研究，特別是在組合數學與計算生物學的交叉研究方面取得了突破。在統計質量控制方向，緊緊抓住國家頒佈的《質量振興綱要(2011-2020)》，為提高我國工業質量控制提供技術上的支援。所有這些大大提升了南開數學的國際地位，並逐步形成了南開數學學科的特色。
南開數學圖書館是以外文數學和統計學原版書、中外文數學和統計學期刊為館藏特色的專業圖書館。現館藏外文原版書26100餘種，期刊22300餘冊。目前該館每年訂購數學和統計學方面的外文原版圖書1000餘冊，外文期刊253種，中文期刊86 種，全文電子期刊230餘種。南開數學圖書館積極為全國數學同仁提供服務，在南開大學乃至全國的數學研究中，發揮了積極的作用。
南開大學數學科學學院招生專業及目錄
025200應用統計(專業學位)
070101基礎數學
070102計算數學
070103概率論與數理統計
070104應用數學
0701J1★生物資訊學
0701J2數理經濟
071400統計學