南開大學物理科學學院前身物理系創建於1919年，是南開大學理科建立最早的系之一。著名物理學家吳大猷教授曾在該系執教，諾貝爾獎金獲得者楊振寧、李政道教授是該系的名譽教授。從這裡已培養出五名中科院院士或工程院院士。建校初期，南開大學設立了物理學課程，先後由孫繼丁先生和徐允中先生講授。1922年正式成立物理系，第一任系主任為饒毓泰先生(任職年限：1922-1930)。1930年至 1937年由顧靜徽教授任系主任(任職年限：1930-1937)。抗戰爆發後學校南遷到昆明，南開大學與北京大學、清華大學組成西南聯合大學。1945 年返津覆校後，由潘孝碩教授任系主任(任職年限：1945-1949)。解放初期，1949年至1952年由劉晉年教授兼任物理系主任(任職年限：1949-1952)。1952年院系調整，原北洋大學物理系與我係合併由江安才教授任系主任(任職年限：1952-1966)。何國柱教授(任職年限：1978-1984)、母國光教授(任職年限：1984)、張光寅教授(任職年限：1987-1991)、潘士巨集教授(任職年限：1984-1987、1991-1997)都曾先後擔任過物理系系主任。
一九八四年根據學科建設和發展的需要，經校行政會議研究決定由原我係半導體物理、無線電物理和電真空物理三個教研室組建成電子科學系及由原我係光學物理教研室的一部分組建成現代光學研究室。一九九八年物理系改建成物理科學學院，由理論物理教授、博士生導師胡北來先生任第一任院長(任職年限：1998-2001)。現任院長劉玉斌博士。
學院的科研實力雄厚，近五年，共承擔各類專案200餘項，其中973國家重點基礎專案14 項，863高技術專案1項，國家自然科學基金專案90項，正式出版教材、著作20餘部，獲國家級和部委級科技成果及教學成果獎40餘項。學院的物理實驗教學中心是國家級實驗教學示範中心，大學物理實驗教學團隊被評為國家級教學團隊。 學院現有專職教師100餘人，其中教授40人，副教授44人。物理學學科有中國科學院院士1人，長江學者獎勵計劃特聘教授4人，國家傑出青年基金獲得者6 人，“跨世紀人才”4人和“新世紀人才”13人。
學院設有物理學、光資訊科學與工程、應用物理學和材料物理四個本科專業。學院除了提供良好的的課堂學習條件外，還積極提供條件開展第二課堂，學生自主組織的“今日物理”系列講座、學術競賽、本科創新工程、數學建模競賽、科研實習和社會實踐活動等使得學生的知識、能力和素質全面協調發展。學院還設有多種獎學金，物理學院設有“基礎學科拔尖學生培養試驗計劃”伯苓班，是教育部物理學基礎科學人才培養基地。
在學生培養方面，既重視培養從事科學前沿探索的基礎研究的科學家，又重視培養高水平的理科應用人才，從事應用開發研究。我們的辦學指導思想特色是：教學與科研，理論和應用並重;既重視基礎理論知識的教育，又重視學生實際能力的培養，既重視高等科技人才的培養，又著眼於國家現代化經濟建設的需要，為國家建設輸送生力軍。各專業設有外語、數學、力學、熱學、電磁學、光學、原子物理、基礎物理實驗和近代物理實驗等共同基礎課。
物理科學學院不僅是基礎科學的人才培養基地，也是現代物理學、光電子材料、光電資訊科學、光子學及材料物理科學的研究基地，是適應我國經濟發展及現代化建設的需要，培養基礎紮實、專業知識面廣的綜合型高階人才的培養基地。該院正在進行的國家級和部委級研究專案有80餘項，近年來獲國家級和部委級科技成果及優秀教材獎40餘項。在“SCI”收入的論文總數位居我校前列。90年代以來，正式出版教材、著作20餘部。
南開大學物理科學學院招生專業及程式碼
070201理論物理
070202粒子物理與原子核物理
070205凝聚態物理
070207光學
0702Z1★光子學與光子技術
0702Z2★生命資訊物理學
080402測試計量技術及儀器
080501材料物理與化學