1我國醫院財務會計制度目前存在的主要問題
1.1管理費用核算不足
我國當前的醫院會計制度中規定，醫院行政部門及後勤部門在管理費用核算時所產生的各種費用，不計入管理費用的科目核算，而是另立科目核算。按照當前醫院會計制度的規定，作為一項間接費用，管理費用是依據藥品與醫療部門的人數比例進行分攤的。很顯然，此種分配方式的缺陷性較為突出，對控制醫療成本也不利。
1.2會計報告體系不完善
通讀我國現行的《醫院會計制度》，可發現在其對醫院現金流量表並未作出明確規定，醫院籌資等也很難被準確反饋給各產權主體的受眾。同時，對籌集資金的具體來源等資訊收集更是乏善可陳，這也導致此類資訊的時效性、完整性難以體現。伴隨我國市場競爭機制的深化和醫療衛生體制改革步伐的加快，社會各界和各個產權主體都對醫院的會計資訊質量提出了更高要求，同時，醫院在運營決策制訂和執行層面，也越來越重視會計資訊的及時準確反饋。毋庸置疑，只依靠幾張報表並不能真實全面地反映醫院的經濟運營情況，為此從實踐需求層面上對醫院自行制訂相關會計報表就提出了更為迫切的要求。唯有如此，才能在既滿足醫院內部經濟管理需求，又能保證會計資訊系統與科學管理要求相一致。
1.3資產增值核算的缺陷
《醫院會計制度》對資產減值處理規定中的壞賬準備作出了規定，這顯然和謹慎性原則不完全一致。無形資產和固定資產等方面的減值風險都不容小覷，醫院應創設各類資產減值準備科目，以為其核算業務中的計提減值做準備。按《醫院會計制度》的規定，醫院各類物資和藥品均要按歷史成本核算，存貨跌價損失並不為其承認，基於以上原因，也讓醫院會計核算體系很難對其資產減值情況準確計量。
2新會計準則對當前醫院財務會計制度的啟示
2.1新會計準則中的財務報告規定在醫院財務報告制度中同樣適用
新會計準則代表著財務報告向國際先進國家學習的趨勢，也準確反映了醫院會計損益情況，同時，對醫院財務各產權主體經濟利益結構作出準確公平的反映。依據新會計準則對醫院財務報告列報等方面的闡述和修正，醫院在出現相似或相同交易事項時能借鑑先進國家的通用報表體系，從而促使會計資訊口徑能保持一致，相互間可進行比較。新會計制度與當前現行制度存在的主要區別表現在於：在所有者權益同為淨資產的基礎上，結餘分配和利潤分配明顯不同，為此應構建和執行現代管理制度，以明晰和保障醫院各產權投資主體的合法權益能有效實現。
2.2新會計準則中的會計目標和會計資訊質量要求對醫院會計制度同樣適用
當前醫院不斷向企業經營化方向靠攏，其事業單位和企業單位兩種性質往往同時展現出來，為此醫院應秉持新會計準則的`要求，對其經營業務中的資產、淨資產等予以規範和準確核算，以促進醫院產權制度的良性改革，進而實現管理機制、經營業務等方面的創新，同時也能為相關機構提供更真實有效的財務會計資訊。例如，新會計準則下的資產減值準則在醫院固定資產，無形資產的計提、減值等方面的核算中同樣適用。醫院通過執行新會計準則進行負債核算，可將其可能存在的風險和負債準確核算出來，通過資本公積、實收資本等科目準確反映資產結構資訊，滿足債權人、相關部門和個人等對會計資訊的要求。
3完善我國醫院現行財務會計制度的有效途徑
3.1完善相關財務報告制度
新會計準則對會計報表至少應涵蓋現金流量表、資產負債表等內容，這對醫院會計資訊質量的保障非常有幫助，還能有效實現醫療資本經營和服務產品經營，對區域內整體衛生資源利用情況充分掌控，壓縮了醫院財務資料。在實踐運營中，針對醫院財務資料進行轉換，對資源成本進行調整，為此應首先對收支總表列表和資產負債表等方面的內容進行修訂。依據非營利性與盈利性區分標準，兩者在收費價格、利潤分配方面存在差異，且醫院各類經濟業務在性質和執行中較為相似或直接相同，這些因素都成為實現財務報告制度統一的基礎。
3.2制定醫院會計基本政策
醫院應將新會計準則作為借鑑樣本，對會計處理程式中的資本性支出嚴格控制，醫院要繼續實施藥品經營與其醫療服務經營相區分，堅持獨立核算原則，依據醫院經營發展實際，制定符合自身發展的政策，有效規範和統一醫院的基本會計模式。基於此，在政策制定中首先應突出實用性，遵循謹慎性原則，明確計量報告政策，提高醫院的資產質量，要依據新會計準則對涉及投資性房地產減值等多項損失予以科學計量和確認，並防止醫院資金結餘行為中出現的人為調節控制現象。其次，在制定相關政策時應突出應用性，將新會計準則置於恪守準則地位，依據醫院的實際環境對相關會計科目進行科學合理的增減，執行公允價值計量模式時應嚴格謹慎，強化醫院的負債核算。結合上述方式適應醫院的負債經營實際，從而解決分攤不均、費用過大等問題。