各級稅務機關、納稅人、涉稅中介服務機構應正確把握稅收管理性、程式性檔案、政策性檔案的關係，考慮到三者既有聯絡又有區別。因此，稅務機關不應把其內部掌握標準、尺度當作政策性檔案來要求納稅人執行。
稅收政策性檔案通常屬於稅收實體法範疇，其規定的內容涉及行為、所得是否屬於應稅範圍、相關費用是否可以扣除等實體性問題。稅收政策性檔案的效力隨著其上位法的變化而變化。而稅收管理性檔案、程式性檔案則不同。其通常是稅務機關為了執行稅收政策、加強稅收管理、規範納稅程式而制定的檔案，其並不一定隨著稅收政策的變化而失效。
稅務管理性檔案的作用，主要是供稅務機關內部使用、參考、把握和考核，其更多考慮的是稅務機關的徵管便利。很多稅務管理性檔案納稅人看不到，也不是納稅人必須遵照執行的檔案。比如:關於會議費稅前扣除問題，有關稅務的管理性檔案規定需要參會人員提供：會議時間、地點、出席人員、內容、目的、費用標準、支付憑證等證明材料，否則不允許稅前扣除。筆者認為：這其實屬於稅務機關內部掌握的標準、尺度，而不是對納稅人會議費能否扣除的政策性規定。難道沒有簽到表就說明會沒開嗎?因此，對會議費稅前扣除掌握的尺度是，證據要與事實結合使用，才能發揮其效用。
稅務程式性檔案是規範徵納雙方的工作程式，是雙方必須共同遵照執行的檔案。比如：在納稅申報環節、申報期限的規定、相關事項報(備)批程式、時間等等。但稅務機關的程式性檔案要做到公開、透明、方便、人性化，才容易被納稅人接受並應用，這也是如何做好納稅服務的一個重要組成部分。
政策面前、人人平等，這將是徵納雙方今後需要共同關注的問題。比如:《企業所得稅法》規定，業務招待費按照發生額的60%扣除，但最高不得超過當年銷售(營業)收入的0.5%，這屬於政策性規定。而對納稅人發生的'專案是否屬於業務招待費的判斷，則不屬於政策性規定，而是管理上的規定。如果簡單的認為只要是餐費就是招待費的稅務判斷將是不準確、也是不全面的，這其中需要有很多相關證據來證明，若徵納雙方出現爭議，通過司法途徑來解決將是最終的選擇。