集團公司成立以來，積極推進薪酬分配制度改革，逐步建立起與社會主義市場經濟體制和航天科技工業發展相適應的薪酬分配體系。
目前，集團公司企業單位實行崗位係數工資制，事業單位實行崗位績效工資制，突出了以崗位工資為主體，以崗定薪，以績定酬，崗變薪變，重在考核的原則，使薪酬分配向一線人員、關鍵崗位、骨幹人員、有突出貢獻的人員傾斜。
崗位係數工資由崗位工資、年功工資、特殊工資、效益工資四個工資單元組成。
崗位績效工資由崗位工資、薪級工資、績效工資、津貼補貼四個單元組成。
集團公司積極探索薪酬分配激勵機制的新方法，形成了以崗位係數工資制和崗位績效工資製為主體，多種分配形式並存的薪酬分配體系。
激勵骨幹人員政策
集團公司高度重視骨幹人員激勵政策，加大對有突出貢獻的拔尖人才激勵制度，提高優秀骨幹人才薪酬水平，積極實施“載人航天工程”等人才特殊津貼和軍崗津貼政策。
同時所屬基層單位結合實際，在加大薪酬分配製度改革的基礎上，大力實施骨幹津貼、高技能人才特殊津貼等一系列穩定骨幹隊伍的激勵政策。
為穩定軍品人員隊伍，調動骨幹人員的積極性，加強軍品崗位人員考核，集團公司對直接從事軍品型號科研的生產、技術、管理人員實施軍崗津貼，並先後兩次調整軍崗津貼標準，軍崗津貼實行動態考核管理，與任務完成情況、個人崗位職責及貢獻直接掛鉤。
員工保障政策
員工保障政策包括最低工資保障、建立各類社會保險、建立補充養老、醫療保險、企業年金等。最低工資保障、建立各類社會保險執行當地人力資源和社會保障部門的政策，實行屬地化管理。
集體公司所屬各單位結合自身實際，在住房分配貨幣化、定期體檢、帶薪休假等方面也進行改革，進一步深化了員工保障制度。
社會保險包括基本養老保險、基本醫療保險、失業保險、工傷保險、生育保險。集團公司要求各單位嚴格按照國家和地方規定參加社會統籌，為員工建立社會保險，並進行監督和檢查，從制度上保障員工的合法權益。
為逐步建立多層次養老保障體系，保障職工退休後的生活，集團公司在企業單位全面推行企業年金制度。企業年金，是指企業及其職工在依法參加基本養老保險並履行繳費義務的基礎上，依據國家政策、法規的規定自願建立的補充養老保險制度。企業年金繳費由企業和職工個人共同承擔，企業繳費不高於企業上年度應發工資總額的5%，個人繳費不低於企業繳費的四分之一。
榮譽獎勵體系
集團公司制定下發了《中國航天科技集團公司榮譽獎勵管理規定》，對國家類獎勵，集團公司類獎勵，成員單位類獎勵，地方、團體類獎勵等進行規範，建立了科學的評審程式、評審原則，提出選拔候選人要向科研生產、經營開發一線做出突出貢獻的骨幹人員傾斜，為員工搭建了公平競爭、擇優選拔的榮譽獎勵平臺。
集團公司不斷完善榮譽獎勵體系，建立了重大獎勵機制，設立了三大獎項，每年評選航天功勳獎、航天創新獎、航天貢獻獎，加大了對拔尖領軍人才、創新人才和優秀人才的激勵制度