南京航空航天大學流體力學學科的發展始於建校之初，在六十年代和七十年代相繼建成了AT-1高速風洞和3米低速風洞，成為當時國內高校唯一的配套大型風洞裝置，也成為本學科點重要的實驗基地。1980年本學科點成為首批具有碩士和博士學位授予權的學科。1988年被評為國家重點學科。在老一代學科帶頭人，首批博士生導師戴昌輝、彭成一、楊岞生、張世英教授等的帶領下，開展了實驗、理論、計算流體力學和內流空氣動力學的研究工作。近幾年來，在非定常流體力學的研究方面也形成了鮮明的特色。目前本學科擁有教師和科研人員40多人，其中教授14人(博士生導師13人)、副教授14人。在教師和科研人員中具有博士學位的達到22人。近五年本學科點科研經費到款5000多萬元。承擔國家自然科學基金13項，國防重點預研專案二十餘項，以及其它重要國防和民用專案100多項。1996年後，獲國家發明獎2項，國家科技進步獎2項，國防科技進步獎3項，省部級科研成果20餘項。近五年來，在國內外重要刊物發表論文200多篇。並有3項教學成果獲江蘇省教學成果獎。本學科點目前已經培養博士近百名，碩士300名。他們中許多人已經成為國內外知名專家，其中有航空工業總公司十佳青年1名，江蘇省跨世紀人才工程和青藍工程的青年學術帶頭人3名;很多校友走上重要的學術和領導崗位，包括將軍、研究所所長、國外著名大學教授等。本學科點在有航空特色的流體力學方面具有雄厚的實力，人才培養和科學研究方面所取得的成就，在國內外產生了廣泛的影響。積極地參與國際合作與交流。多次舉辦國際學術會議。同德國宇航研究院、法國達索飛機公司和俄羅斯、美國、英國、新加坡等國家的有關機構保持長期的合作研究關係。
本學科已形成5個具有明顯特色和優勢的研究方向，它們是：1、計算流體力學，該方向在邊界元與有限元方法在可壓縮流計算中的應用，非結構網格生成技術，複雜外形飛行器的CFD計算等方面在國內處於領先;2、非定常空氣動力學，該方向在零質量射流的研究及其在流動控制中的應用，過失速大機動的實驗研究，跨音速動態氣動試驗聲環境研究，直升機旋翼流場的實驗與計算研究等方面在國內處於領先地位;3、實驗流體力學，在風洞洞壁干擾研究、風洞試驗與測試技術研究、旋流模擬的實驗研究、向量噴管內流氣動研究、排氣引射器研究中具有特色。同時承擔了幾乎所有國防重點飛機型號和部分導彈型號的相關試驗任務和許多重要的民用流體力學的實驗專案;4、內流空氣動力學，在飛行器推進系統進、排氣內流研究，以及航空發動機進發匹配研究等方面居國內領先地位。葉輪機械內部複雜流動、損失機理和葉型設計理論的研究等葉輪機械非定常流研究方面形成了葉輪機械氣動熱力研究方向的特色;5、飛行力學，本方向在飛行品質和非線性飛行力學研究方面一直處於全國研究前列，最早在國內開展飛機極限環振盪、分支和突變理論在飛行力學中的應用研究，特別是在非線性飛行力學領域的理論研究方面處於國內領先。
本學科在今後五年中，將拓展新的研究方向(例如生物流體力學研究、微機電系統中的流體力學問題等)，力爭獲得國家在國防和國民經濟建設中的重大科研專案，使人才培養，科研裝置建設，科研專案和成果走上良性迴圈的軌道，進一步加強同國內外科研機構的學術交流，使本學科成為國內一流學科，並在國際上具有廣泛影響、最終成為國際一流的重點學科。