隨著財政國庫集中支付改革的深入推進，行政、事業單位新的會計制度的實施，財政資金執行流程和行政、事業單位的會計核算發生了很大變化，為使預算單位的資金支付越來越快捷、會計核算越來越標準，電子化管理支付應運而生。什麼是支付電子化，其基本理念，就是扔掉卷櫃，甩掉檔案盒，使用“電子憑證庫”，儲存電子資料資訊，實現真正意義上的“無紙化”。利用現代化的資訊網路技術，取消紙質憑證和單據流轉，依據電子指令辦理財政資金支付及清算等業務。
一、支付電子化管理的優勢
(一)改變了傳統基層單位的工作方式
在堅持國庫資金直接支付和授權支付兩種基本方式不變的原則下，電子支付改革實現了直接支付全程網上辦理;新研發了授權支付自助櫃面系統，會計坐在辦公室裡就可辦理業務;通過電子校驗，不再進行電子資訊與紙質單據的人工核單;設定計算機系統對賬功能，早發現問題，早解決問題，不僅減少了會計人員的“跑腿”工作，而且節約了大量時間。
(二)改變了財政資金執行監控方式
實行支付電子化管理以後，將傳統模式下各個相對分散的人工稽核控制整合成一個完整的管理鏈條，實現了資金支付“環環相扣、互相牽制、有來有去”。 拿授權額度的下撥來說，以前財政下撥額度給銀行，基層單位根據額度指標進行支付，按要求是專款專用，但有時基層單位會根據實際需要自行調整，銀行看見支票也就付款。實行電子支付化後，重新界定直接支付和授權支付的範圍，真正的稽核權在財政部門，由他們根據基層單位的申請下撥，這就保證了稽核的專業性，也提高了資金的安全性，保證了財政資金的流向，降低了財務風險。將資金管理制度的規範性要求設定在系統控制軟體裡，靠系統管資金、管賬戶。
(三)改變了憑證管理方式
每個月填制憑證、記賬、報賬、報表、訂憑證是每位會計的日常工作，實行電子支付化後，會計的工作發生了改變。取消彙總單，如原來月底為了對賬方便，會計去銀行列印當月彙總支出對賬單，現在不需要了，會計直接進入系統，根據實際情況對電子憑證的明細資料分類彙總，自動生成各種口徑的報表或彙總單;減少憑證聯次。如直接支付申請書共三聯，每一聯要蓋章，人工報送。實施電子支付化後，電子憑證的.資料儲存是同一份，各方可以共享資訊，不同的單位可以通過業務系統的報表配置功能，讀取需要的憑證瀏覽列印。減少內部過程形成的紙質憑證，改變傳統模式下的紙質憑證儲存，直接儲存電子資訊。(四)樹立了財政資金新安全觀用電子印章代替傳統的手工大紅印章，使用系統提供的雙份“電子憑證庫”、具有唯一性的各類憑單印章和電子簽名等技術手段，保證未經授權的進不到支付系統，經過授權的使用者按流程規則辦理業務，使支付電子化管理安全性更高，靠資訊科技解決傳統資金管理中資料篡改和印章仿製問題。
二、電子支付化實行過程中面臨的問題
支付電子化系統制度不夠健全，執行維護和安全措施不到位，違反財務管理規定，可能導致資訊洩露，系統無法正常執行。業務流程規劃不合理，可能造成重複審批或審批漏洞，導致工作出現失誤，延誤資金撥付速度、國庫資金流失。給財政部門和預算單位造成巨大損失。支付電子化管理軟體系統開發有短板，不符合行政事業單位內部控制制度要求，key授權管理不當，可能無法對各業務流程實施有效控制。財政部門、清算銀行、預算單位在審批流程、資金撥付等環節出現盲點，可能讓不法分子乘虛而入。目前行政事業單位會計人員素質參差不齊，部分行政事業單位的財會人員對於國家政策理解不到位，執行流程不正確，難以很好的適應財政制度的改革，在貫徹落實過程中存在偏差，干擾了正常的支付過程。三、優化支付電子化的業務流程，提高財政資金支付效率
制定電子網路支付制度，首先軟硬體環境管理層面，堅持財政專網登陸嚴禁通過網際網路使用;其次在新舊模式管理層次上，實現在不同業務型別、不同單位的傳統業務和電子化管理的有機銜接;從會計層面來講，應建立健全關於電子資訊化的相關規定，如有違反規定者給與處罰。嚴格遵循電子化管理的業務規則和嚴謹要求，進一步規範各環節流程。支付電子化是一項涉及財政部門、預算單位、清算銀行、代理銀行等多單位辦理業務的軟體系統，必須保證網路資訊保安準確，營造快速、高效的網路通道。通過集中梳理支付業務流程，認識到電子化業務處理就是“支撐控制元件”和“自助櫃面”的處理，並在此基礎上設計了全新業務流程，並全面準確“固化”到軟體系統中，為依法依規管理國庫提供了有效途徑，促進了資金支付業務處理的標準化。依據內部控制管理規定，明確簽章業務節點和簽章崗位許可權;明確憑證樣式和印章位置，減少非重點控制環節;採取多崗位制衡，形成安全閉環，對使用者實行實名身份認證管理，落實“一人一key、繫結身份、責任到人、嚴控許可權”的原則，履行自己的崗位職責，強化操作人員的安全意識。提高行政事業單位會計從業人員的綜合素質，國庫電子支付方式的推行離不開財會人員的工作。完善的電子支付化規程需要高素質人才操控。
會計人員必須具備高尚的職業操守，熟悉相關法律法規，掌握專業技術，熟練地電腦操作能力。具備了天時-財經政策、地利-軟體系統、人和-所有財務工作者的努力，一定能順利實施電子支付化改革。