中國農業大學動物科技學院成立於1993年，它的前身是北京農業大學畜牧學系，至今已有80多年的歷史。1921年，北京農業專門學校就設有畜牧學科;1923年，北京農業專科學校改為國立北京農業大學，其畜牧學科改為畜牧學系，這是國內最早成立的畜牧學系。
1949年中華人民共和國成立後，中央人民政府對高等院校進行院系調整，由北京大學、清華大學、華北大學三校的農學院與輔仁大學農學系合併成立了北京農 業大學，北大、清華、華大三校的畜牧學系合併成為北京農業大學畜牧學系。1993年，根據學科發展需要，經農業部批准，在原北京農業大學畜牧學系的基礎 上，組建成立了北京農業大學動物科技學院。從1921年北京農業專門學校畜牧學科至今，先後有崔步瀛、張贄、汪國輿、吳仲賢、張仲葛、湯逸人、安民、吳常信、張沅等教授任系主任，1993年起由吳常信教授擔任院長。
學院本科教育設“動物科學”、“草業科學”等兩個本科專業;研究生設動物遺傳育種與繁殖、動物營養、草業科學和畜牧生物工程4個碩士專業，以及動物遺傳育種與繁殖、動物營養和草業科學3個博士專業;有畜牧學科博士後流動站1個。擁有動物遺傳育種與繁殖學、動物營養與飼料科學和草業科學三個國家重點學科。
學院現有教師122人，其中中國科學院院士1人;國家級教學名師1人，北京市教學名師1人;教授和研究員30人，副教授和副研究員42人;博士生導師27人，碩士導師40人;獲“國家級有突出貢獻的中青年專家” 3人，“國家傑出青年科學基金” 6人，國家“百千萬人才工程”第一層次、第二層專家4人。具有“長江學者獎勵計劃”特聘教授崗位2個。
學院擁有1個國家級重點實驗室——動物營養學國家重點開放實驗室，2個國家級中心——國家飼料工程技術研究中心和國家家禽測定中心，1個國家級野外站——河北沽源草地生態系統國家野外科學觀測研究站，有動物遺傳育種、草地植被恢復與重建和草業科學 3個部級重點開放實驗室，還有5個部級研究中心——農業部飼料工業中心、農業部飼料效價與安全監督檢驗測試中心、農業部家禽品質監督檢驗測試中心、全國種豬遺傳評估中心和農業部牧草與草坪草種子質量監督檢驗測試中心(北京)。有教學實驗中心1個，校內實習基地10個，校外實習基地18個，其中。此外，2個國家一級學會祕書處(中國草學會和中國馬業協會)，10個二級學會祕書處(世界家禽學會中國分會、動物遺傳育種學分會、動物數量遺傳學會、動物營養學分會、養牛學分會、養豬學分會、動物繁殖學分會、草坪專業委員會、種子科學與技術委員會和青年工作委員會)掛靠本院。這些中心、實驗室、野外站、實習基地和掛靠學術團體，為具有創新精神和實踐能力的人才培養提供了強有力的條件保障。
學院始終圍繞我國國民經濟發展中的重大科技問題開展科學研究。2005年，專案總經費額 4394萬元。“十五”期間，本院共承擔科研專案200餘項;承擔 “國家重點基礎研究計劃973專案”、“科技部863專案”、國家自然科學基金重點和重大專案、國家傑出青年基金專案等22多項;國家科技攻關等省、部重點專案20多項，國際合作專案13項，其它專案100多項。已經獲得國家、省部級科技進步獎17項，登記動植物新品種3項，申請發明專利35項。
改革開放以來，學院已派出學生和訪問學者60多人，到10多個國家進行學習和合作研究。目前學院與美國、德國、加拿大、英國、紐西蘭、韓國、日本等國的10多所大學保持著密切的科研合作關係。