北京電影學院動畫學院成立於2000年，以培養動畫導演、高階動畫創作、製作人才為主要目標。動畫學院的前身是北京電影學院美術系動畫專業，該專業成立於1952年。多年來，曾培養出阿達(動畫片《三個和尚》的導演)、戴鐵郎(動畫片《黑貓警長》的導演)、嚴定憲(動畫片《哪吒鬧海》的導演)、林文肖(動畫片《雪孩子》的導演)、胡進慶(水墨剪紙動畫片《鷸蚌相爭》的導演)等老一輩動畫藝術家和一大批中、青年動畫導演及優秀動畫人才，為中國動畫的發展做出重要貢獻。2000年，北京電影學院為了適應動畫發展的需要，在動畫專業的基礎上成立了全國第一所動畫學院。現開設了一個博士研究方向(電影藝術創作理論方向)、六個碩士研究方向(動畫創作及理論方向、動畫創作與多媒體應用方向、動畫史論方向、動畫劇作方向、電視動畫製片方向和動漫策劃方向)，五個本科專業方向(動畫藝術方向、電腦動畫方向、漫畫方向、遊戲設計和動漫策劃方向)，還開設了專業進修班、教師進修班及專科升本科班。
動畫學院充分利用傳統動畫教學優勢與計算機數字新科技相結合的模式，以動畫創作為主，兼顧電影、遊戲、多媒體等各個學科的學習創作以及相關理論和史論的研究;廣泛開展國際交流活動，進行開放式教學，保證“教”和“學”保持最新觀念。動畫學院具備世界先進水平的配套教育設施，現在有動畫實驗室2個、遊戲實驗室1個、定格實驗室1個、5D(立體動感)動畫電影實驗室1個、3D沉浸式實驗室1個，為本院的教學創作和科研提供了良好的物質基礎。
動畫學院先後編輯出版了《動畫藝術辭典》《遊戲互動設計-Virtools應用教程》、《影視動畫專業英語》、《動畫電影藝術短片<飛>創作》、《動畫素描》等上百本動畫教材。這些教材在國內外同類教材中居領先地位，深受好評。預計陸續出版一百種，將成為國內範圍最廣泛、內容最豐富的系列教材。
動畫學院堅持理論研究和創作實踐相結合。專業教師堅持創作，以帶動教學同時積極鼓勵學生進行具有獨立精神與創作性的動畫創作，並取得了很好的成效。多年來教師和學生的作品多次在國內外獲獎。2001 年12月動畫學院創立了“動畫學院獎”專業性動畫評獎活動，每年舉辦一屆，現已舉辦十二屆，已經成為一個非常有影響力的國內外動畫交流活動。
在今後的發展中， 北京電影學院動畫學院根據“一定要大力扶持我國動漫遊戲民族原創產品的發展，擴大對動漫遊戲方面人才的培養，並要盡力加快中國動漫產業及遊戲產業的發展” 的重要指示，積極落實中央加快動畫產業發展的精神，率先切實地持續發揮學院在培養人才等各方面的領先優勢，帶動並加快整個影視動漫及遊戲產業的人才培養，力圖將我國動畫專業創作人才的培養規模尤其是質量提高到新的水平、使人才培養更趨於專業化，將北京電影學院動畫學院建設成為國家原創動漫遊戲的人才培養基地，為中國電影及動畫事業做出更大的貢獻。