一、血象與血沉
白血球總數一般正常，淋巴細胞常偏高，紅血球及血紅蛋白常偏低，呈輕、中度貧血，以潰瘍型患者為多見。在活動性病變患者中，血沉常增快。
二、糞便檢查
增生型腸結核糞便檢查多無明顯改變。潰瘍型腸結核糞便鏡檢可見少量膿細胞和紅血球。糞便濃縮找結核菌，只有痰菌陰性時，才有意義。
三、X線檢查
X線鋇餐造影或鋇劑灌腸檢查對腸結核診斷具有重要意義。併發腸梗阻的患者只宜進行鋇劑灌腸，以免鋇餐檢查加重梗阻，潰瘍型腸結核腸段多有激惹現象，鋇劑排空很快，且充盈不佳，病變上下兩端腸段鋇劑充盈良好，此稱為跳躍徵象。增生型腸結核等徵象。有腸梗阻時，近端腸曲常明顯擴張。
四、纖維結腸鏡檢
可直接觀察全結腸、盲腸及回盲部的病變，並可行活檢或取樣作細菌培養。