隨著醫療衛生事業快速發展，基層醫院業務的拓展，以及二級醫院評審需要，許多縣級醫院都成立了微生物實驗室。但很多實驗室條件簡陋，技術人員缺乏，從標本的採集、接種培養、菌種鑑定到藥敏試驗，存在許多不規範、甚至錯誤的做法和結果。以至於不能及時提供臨床指導價值，誤導治療，延誤病人的有效治療時間。所以必須加強基層微生物實驗室的建設和技術人員的培養，使微生物實驗室能為臨床合理使用抗菌藥物提供可靠的、有指導意義的資料。
1 存在的問題
1.1 管理問題
1.1.1 領導不夠重視 微生物實驗室作為二級醫院評審必備條件，一些醫院雖然成立了微生物實驗室，但只是形同虛設。微生物實驗室的標本從採集到出報告最少需要兩天時間，大夫抱怨回報結果時間太長，寧願經驗性用藥也不做細菌培養。一份標本(取樣盒、接種平板、鑑定管或鑑定板、藥敏紙片)成本最低需要70元，高的需要120元，但二甲醫院的收費標準只有90元，醫院的領導從經濟效益出發，不願做前期投資，不注重實驗室建設和人員培養。科室要成本核算更不願意花費大量人力和財力去建設微生物實驗室，使實驗室裝置簡陋，技術人員缺乏、斷檔，正常工作開展的不到位。
1.1.2 科室管理不到位 基層醫院微生物實驗室在科室的佈局大都不合理，可利用操作空間小，實驗室的消毒設施不完善，廢棄的標本不嚴格按照醫療垃圾的處理辦法實施。實驗室制度不健全，沒有可執行的SOP檔案，沒有標準菌株，不做室內質控，這樣很難保證菌種鑑定、藥敏實驗結果的準確性。實驗室工作人員觀念落後，對新知識掌握不夠，專業人員不注重自身專業知識的提高。
1.2 技術問題
1.2.1 標本採集由於沒有SOP檔案指導，缺乏標本採集制度和標準，大夫取標本隨意性強，大量送檢標本不合格。如傷口分泌物，大夫用取樣棒隨意蘸取膿液送檢，這樣的標本陽性率很低;尿標本留取時，不告訴病人採集標本前的消毒以及留取標本的注意事項，致使採集標本汙染嚴重等等，這一系列不規範的操作嚴重影響臨床診斷結果。
1.2.2 標本的培養由於實驗室條件簡陋，沒有CO2培養箱，一些苛養菌生長不良，使血液、腦脊液等標本培養的陽性率減低。實驗室沒有質控菌株，不注重室內質控，報告給臨床的結果沒有質量保證，導致臨床大夫不相信培養結果，不做細菌培養。有些醫院為了節約材料，製作的培養基厚度不夠，細菌生長不良，甚至用一個平板接種兩個標本，嚴重違反操作規程。
1.2.3 藥敏試驗，基層醫院微生物實驗室裝置簡單，藥敏實驗多以K-B法為主，各實驗室在菌懸液濃度的配製、藥敏紙片的選取、黏貼紙片間距等方面都存在很大差異;結果的判斷誤差大，報告給臨床的藥敏結果(敏感和耐藥)不準確，不能正確指導臨床合理用藥。
2 解決方法
2.1 管理和裝置 領導和科室管理人員要從思想上改變對微生物實驗室的認識。微生物實驗室投資較大，領導要重視微生物實驗室的前期投資建設，實驗室要準備最常用的鑑定試劑、染液、藥敏紙片，開展最常規培養工作，有條件時購置一些先進的儀器，提高實驗室的'鑑定水平。
2.2 人員配置要選用有強烈事業心和責任感的人員擔任細菌室工作，人員要相對固定不能兼職，在不斷學習理論知識的同時，還要學習別人的經驗，遇到不常見的細菌要及時查詢相關資料，要牢固掌握基礎理論知識並應用到實踐中，在此基礎上要多看相關的雜誌，多瞭解一些新的知識點，要不斷更新自己理論知識和理念。
2.3 建立完善的實驗室工作制度微生物實驗室要編寫行之有效的SOP檔案，建立切實可行的實驗室工作制度，編寫詳實的標本採集手冊，下發臨床各科室;對臨床送檢標本，要進行嚴格稽核，對不符合要求的標本，要堅決退回，並做好登記，積極和臨床科室溝通，解除臨床科室對微生物實驗室的誤解。
3 討論
耐藥菌的比例的不斷上升，泛耐藥菌和全耐藥菌的不斷出現，與盲目使用抗菌素和廣譜抗生素的濫用，有很大關係。為了控制細菌耐藥性和多重耐藥菌的出現、預防醫院感染的發生，加強基層醫院微生物實驗室的建設，重視基層醫院微生物實驗室的工作顯得尤為重要。只有充分發揮基層醫院微生物實驗室的作用，才能使合理使用抗菌藥物以及醫院感染控制得到落實和解決。