一、加強醫院會計監督職能的重大意義
加強醫院會計監督職能的重大意義主要有一是有利於保證醫院財務活動的合法性;二是有利於保護醫院資產的安全和完整;三是可以有效的保證醫院會計資訊的真實性;四是實現醫院經營目標的有效保證 五是有利於保護幹部，促進單位醫務人員及財務人員的清正、廉潔。
二、目前醫院會計監督存在的主要問題
1.會計監督法律約束機制不健全
雖然新的《會計法》已經頒佈，但是在實施過程中缺乏與之相應配套的法律法規。這就為醫院在進行會計監督職能時帶來了很多的困難，大多數醫院對會計監督、審計監督的概念比較模糊，常常將兩者混淆。但是事實上審計監督不屬於會計監督，它實際上是屬於事後監督的範疇，也就是說它是在會計監督之後再實行監督作用，目的是在於檢查會計監督的真實性與有效性，而會計監督的主要職能是對財務活動中財務收支情況進行事中監督的過程。
2.醫院內部審計存在問題
隨著我國經濟的快速發展，市場化經濟程序不斷深化，對醫院發揮其審計職能的要求也越來越重。
(1)部分醫院存在對內部的審計認識程度不深，常常將內部審計停留在檢查錯誤與糾正弊端的層面上，沒有將審計工作與整個醫院的經營活動聯絡起來。
(2)部分醫院沒有制定完善的'審計制度或審計制度不科學、不繫統、不成文。審計沒有系統性的規則制度就不能使審計工作落到實處，導致很多醫院的內部審計工作只停留在做表面功夫上。
(3)審計工作的獨立性不強，甚至出現財務負責人兼任審計負責人的奇怪現象。很多醫院的審計工作在實施的過程中經常受到其他部門的干擾，無法獨立的完成作業，這樣就導致內部審計工作無法真正發揮其職能，讓審計工作流於形式化。
3.內部會計控制觀念薄弱
內部會計控制涉及到醫院的各個經營專案，體現醫院在生產、經營、管理等多個方面需求。它不僅是財務部門的分內之職，更是需要與各部門之間共同合作來完成的工作。但是，在目前大多數醫院的管理中，都缺乏對內部會計的控制理念，沒有形成對加強對會計控制建設的認識，沒有制定合理規範的內部會計控制制度，總認為內部控制是財會部門的事。沒有形成優化企業管理模式的意識，仍舊遵循傳統的重發展、重經營、輕視效益的經營模式。這種思想的普遍存在最終導致了醫院在管理與預算方面達不到其預想的功能，這種狹隘的控制觀也嚴重影響了醫院內部控制體系的建立，如此下去將無法為醫院帶來可持續發展的經濟模式，阻礙了醫院良性運轉的發展前景，也不利於我國現代化市場的建設與推進。
4.醫院會計人員綜合素質有待提高
會計人員是會計監督工作的主要執行者，在會計管理工作中起了至關重要的作用。但醫院由於是效益較好的部門，導致財務部門成為各種關係戶解決就業的“福地”，人員總體素質較低。隨著我國市場化經濟的不斷髮展與提高，對會計的人員的要求也在逐步加強。
三、加強醫院會計監督作用的幾點建議
1.加大醫院審計監督的力度
醫院要保證新政策能有效地落實到實處，確保醫院的會計監督職能充分發揮其作用，並且對會計工作的監督過程施以合適的監督。會計工作要經過三個稽核階段才算完整：
(1)在醫院的各項醫療服務中，要對原始憑證進行稽核，這些原始憑證包括各種表格、收費票據等等。它的內容是否正確、是否符合我國的相關的規定、是否全面反應了醫院的業務活動內容等，都必須通過醫院會計部門進行稽核確認。凡有不符合相關規定的內容都不允許報銷。
(2)對記賬憑證的稽核，要以《會計基礎規範》為依據。主要檢查其是否具有合法性、真實性、準確性。要稽核會計中記賬憑證填制的及時性，記錄摘要的簡潔扼要性等，這些內容是否全面完整，記錄是否真實客觀，能否全面真實的反映出醫院的各項經濟活動，這些業務是否與原始憑證相吻合，有沒有出現漏記、錯記等現象，醫院會計科目的使用是否在規定範圍內，表達是否準確無誤。這些都需要審查部門進行審查核對。凡是沒有經過審查人員核實簽章的記賬憑證時，出納人員都不能接受審理，記賬人員也不能進行登記，以保證稽核人員的稽核權。
(3)對賬簿的稽核要反覆審查。刪除其中虛假的資訊儲存下那些真實的資訊，去掉賬目中的“水份”。做到表格與賬目相符、賬目與實際相符。對管理不善的專案和應該改進的工作要提出合理的建議和改進措施，要讓會計報表真正成為管理階層預測經濟前景、編制下期計劃、評價經營業績的科學依據。
2.完善醫院會計監督制度
以健全醫療機構內部財務制度、執行會計監督醫院會計制度是我國醫院財務管理工作必須遵循的基本規範，也是醫院主動適應社會主義市場經濟體制，規範醫療服務市場的經營行為，促進醫院努力實現集約型經營管理的重要制度。內部會計控制制度是各單位正確貫徹執行國家會計法律法規、規章制度的重要基礎。建立健全內部會計控制制度，加強對會計資訊的採集、歸類、記錄、彙總等過程和相關環節的監督和管理力度，可及時發現並有效糾正會計工作中出現的問題。提高會計資訊質量，真實完整地反映單位經濟管理活動。
3.加強財會人員隊伍建設
加強醫院財會人員隊伍的引進和建設，加強財務人員的職業道德和業務素質教育。
一是醫院要嚴格實行會計人員准入制度，嚴格按照財政部的規定執行。二是要加強對醫院所有工作人員進行素質培訓。同時，要重視對財務人員的業務培訓。
總之，醫院會計監督在醫院管理中起著重要作用。我們要正視醫院會計監督的職能，將醫院會計監督作為企業內部控制機制的一個重要組成部分，以確保醫院各項經濟活動的合法性、合理性，為醫院的管理和決策服務，從根本上解決問題更好地為人民健康服務。