成立預案編制小組。落實成員的職責，明確分工，是編制應急預案的首要步驟。水上突發事件應急行動來自不同單位、不同專業領域，需要這些職能部門積極參與，在相互信任的基礎上進行密切的配合與協調。因而，在編制預案時，通過成立預案編制小組，將各方專家有機地組合起來，共同參與編制，達成一致意見，保證應急預案的準確性和完整性。預案編制小組的成員單位一般包括：海事、安監、醫療衛生、民航、通訊、公安、消防、新聞媒體以及責任水域範圍內擁有水上救助力量的航運企業、船公司等相關單位。
風險識別和評估。風險識別、分析和評估的結果不僅有助於深入具體地制定應急反應程式，而且有助於制定出切實可行的應急反應措施。在對責任水域的地理環境、水域特徵、氣象條件等因素進行綜合分析的基礎上，結合轄區內曾經發生的水上突發事件，將其分門別類，分析其誘因，識別未來可能發生的水上突發事件，合理劃分水上突發險情等級。針對不同級別的水上突發事件，制定不同的預案來應對。
應急能力評估。在風險評估的基礎上，對現有應急裝備、應急隊伍等應急能力和應急資源進行評估，包括應急人員的技術、經驗和資歷，以及應急設施、裝置、裝備、物資等情況，查詢需求和不足。制定預案時，在評價與潛在風險相適應的應急資源和應急能力的基礎下，量力而行，選擇最現實、最有效的應急反應策略。
建立應急組織指揮體系。對分散的部門資源進行重新組合和優化，明確應急反應的組織機構、參加單位、人員及其職責，確保預案啟動時，應急救援過程的各個環節和崗位都有相應的人員去落實和實施。
編制預案文字。針對未來可能發生的水上突發事件，結合風險識別和應急能力評估的結果，依據有關法律、法規及國際公約編制應急預案。在編制過程中，要與《國家突發公共事件總體應急預案》和其他地區的'水上突發事件應急預案相銜接，儘可能減小工作量，避免預案內容不必要的交叉重複，保證各級政府的水上突發事件應急預案能夠有效地協調和相互對應，組成有機整體。
評審與釋出。為確保應急預案的科學性和實用性，主持編制預案的單位（一般為海事部門）應依據我國有關方針政策、法律法規及規範性檔案的要求，組織開展預案的內部和外部評審，取得政府主管部門和相關應急機構的認可。內部評審是預案初稿編寫完成後，為保證預案語言簡潔通暢、內容完整、語法規範，在編寫小組內部實施的評審。外部評審是請外地同級海事部門、上級主管機關、有關專家學者等從政策、法律、技術等不同角度，對預案結構和內容進行的審定。評審通過後，履行批准手續，按有關程式進行正式釋出，並報送上級主管部門和應急機構備案。
演習與維護。應急預案編制完成後，通過實施預案，檢驗其有效性，主要包括：應急預案宣傳、教育和培訓，應急資源的定期檢查落實、應急演習和訓練。應急預案發布後，各相關職能部門和應急機構要有計劃地結合預案內容，廣泛地開展宣傳、教育、培訓，使水上應急搜救人員熟悉、掌握預案中與其承擔的職責和任務相關的工作任務、程式和標準。應急預案的牽頭部門，應根據預案的內容，定期檢查應急人員、設施、物資等應急資源的準備狀況，保持應急資源處於戰備狀態。定期組織開展應急演習和訓練，檢驗預案中的行動程式在水上搜救演習過程中的合理性、有效性和可操作性，評估應急人員的技能和整體協調性，從中查詢問題並加以改進，為預案的修訂與更新提供參考依據。