(1)單株抗體固有的親和性和侷限的生物活性限制了它的應用範圍。由於單株抗體不能進行沉澱和凝集反應，所以很多檢測方法不能用單株抗體完成。
(2)單株抗體的反應強度不如多株抗體。
(3)製備技術複雜，而且費時費工，所以單株抗體的價格也較高。
單株抗體定義
由單一B細胞克隆產生的.高度均一、僅針對某一特定抗原表位的抗體，稱為單株抗體。通常採用雜交瘤技術來製備，雜交瘤(hybridoma)抗體技術是在細胞融合技術的基礎上，將具有分泌特異性抗體能力的致敏B細胞和具有無限繁殖能力的骨髓瘤細胞融合為B細胞雜交瘤。用具備這種特性的單個雜交瘤細胞培養成細胞群，可製備針對一種抗原表位的特異性抗體即單株抗體。