一、目前鐵路運輸收入管理存在的問題
（一）鐵路運輸收入管理基礎環境依然薄弱
運輸收入管理基礎工作仍需強化，特別是在管理所需的組織和人員配備，管理技術更新方面欠賬太多；從組織與人員配備來看,有些車務段下屬車站沒有專門的收入管理人員,收入管理由財務人員或經營管理人員以兼職的形式進行,這些人員大部分不具備良好收入管理所需的綜合業務技能,特別是在下級各路段、站點的管理中,業務負責人或站長大部分都在財務方面依賴財務科室或上級部門管控,從而形成收入管控的漏洞。在技術條件上,現在鐵路票務等業務都實現了網路化,而收入管理的網路體系建設卻相對有些落後,有些資料資訊還不能共享,還需要人員重新錄入。除了運輸業收入系統核算較為健全外,很多鐵路局非運輸業收入的核算管理則比較粗放,進入收入系統的資料不夠細化而加大了收入管理的難度,況且在財務資訊網路共享平臺建設方面也差強人意,收入監管的難度較大。
（二）鐵路運輸收入管理內部控制機制不夠完善
鐵路運輸收入的實現具有較強的時效性，涉及的收入人員層面多、範圍廣，與客貨運輸工作的各個環節密不可分。雖然現行的有關運輸收入內部控制制度對內部運輸收入管理控制做了一些規定，但仍然存在著制度辦法不繫統、不完善的問題。有的僅是從財務會計制度和內部財務控制制度中選擇某些關於收入控制的條款組成收入管理制度,或者機械的將企業及其他單位的收入管理制度照搬過來,出現很多不適應實際而無法執行的情況,影響了收入管理作用的發揮。近些年來，全路在加強運輸收入監督檢查方面做了大量工作，也取得了較好的成績，但違反運輸收入紀律的問題仍普遍存在，要解決好這些問題，除了繼續加大監督檢查的力度外，根本的措施是建立健全一套科學有效的運輸收入管理內部控制制度，實現對運輸收入全過程的監督。
（三）鐵路運輸收入管理執行方面不夠規範
一是收入預算缺乏實際的執行。收入預算是進行科學收入管理規劃的有效手段,鐵路局將鐵道部對本局總體的收入預算指標根據各站段上年經營業績分拆到各站段收入預算。這種分拆缺乏必要的靈活性,因而使預算目標可能不夠合理。二是收入管理程式執行不到位。表現在收入財務資訊的記錄與核算上不合規的地方較多。
二、進一步加強鐵運輸收入管理工作的措施
（一）優化鐵路運輸收入工作基礎環境，規範基礎工作。
（1）加強隊伍建設，合理配置運輸收入管理人員。一是提高運輸收入管理人員素質。鐵路企業應按照鐵道部《關於加強全路財會隊伍建設的意見》要求，提高運輸收入管理人員政治素質、業務素質，改善學歷結構，加強作風建設。二是要嚴格按照《鐵路會計基礎工作規範》和運輸收入管理內部控制制度的要求，配齊、配好收入機構負責人和其他運輸收入管理人員。同時加強業務培訓，提高技能水平。
（2）提高管理的現代資訊化。運用現代資訊科技，達到合理配置各項資源，提高收入管理工作效率的目的。建立計算機網路的整合系統是現代資訊科技運用到鐵路運輸收入管理中的具體體現。這個系統可以使先進的管理思想實現制度化、程式化，這樣可以杜絕人為工作的不自覺性，實行規範化的工作管理模式。計算機網路整合系統可以及時、準確、完整的將有價值的資料進行分析、歸納，傳送到需要此資訊資料的管理層，充分實現了資訊資源的共享。隨著網路售票、POS機等新型服務方式的不斷投入使用，對工作人員的業務水平和技能提出新的要求，需要管理者和應用者不斷學習新技術、新裝置的應用效能和應用技巧，提高管理者的`指導能力及系統應用人員的操作水平。因此，應當有計劃、分層次地對職工進行資訊化管理理念、計算機應用、資訊化管理系統等方面知識的教育培訓，通過強化系統操作方法和操作技能的培訓，規範操作人員的操作行為，提高工作人員的操作技能，達到認真負責並及時提供準確資訊的效果。
（二）加強制度建設，健全內部控制體系。
（1）結合本單位的實際情況，不斷健全和完善內部運輸收入管理控制制度，並根據管理體制的變化情況，及時修訂、完善內部控制制度，加強對所屬單位的指導，確保鐵道部各項規定，完善內部控制機制通過完善內部控制機制，強化責任落實和運輸收入管理，確保入完整。
（2）建立以人為本的運輸收入內部會計控制機制。對於鐵路企業運輸收入內部會計控制來說，人的主觀能動性很重要，以人為本作為構建內部會計控制機制已經被越來越多的企業所接受，保證企業成員具有一定水準的誠信和能力是內部會計控制有效的關鍵因素。所以，需要強化鐵路企業內部的會計誠信管理，使運輸收入人員樹立誠信觀念，讓運輸收入人員意識到會計誠信和職業道德的重要性。
（3）建立和完善幹部逐級負責制從幹部所處的地位和作用出發，從站段長、副職、車間主任等逐級規定幹部對運輸收入管理應負的責任。落實具體工作人員負責制進一步完善具體工作人員的工作程式和考核機制，做到有任務、有檢查、有考核評比，解決誰主管誰負責的問題。從而增強相關人員的責任心和責任感，解決一些人員執行規章制度不嚴格，把關不嚴，稽核貨物品名不細緻的現象。
（4）按照嚴格管理、嚴格考核的要求，形成激勵約束的長效機制，將收入管理工作規範化納入企業管理一併考核單位和單位負責人，將收入管理工作規範化納入收入主管人員和其他收入人員的日常業績考評範圍。要定期組織對規範化工作的情況進行嚴格的考評，將考評結果與責任人的經濟利益掛鉤。對於在各種檢查監督發現的不規範問題，應對單位和相關責任人員進行處罰。