行政事業單位的預算編制是很重要的，事業單位在進行一個專案時，首先要分析專案的可行性，來確定是否對其開始資金分配；而在實際當中，很多專案的預算編制不是在經過領導集體論證後製定的，而是有專案的領導主導完成的，或是根本沒有預算編制，這樣不經過專案的分析規劃、不經過事實論證的預算編制，只會導致專案執行時經常出錯，延誤專案工期，耽誤專案質量。還有就是預算編制不僅僅是事業單位財務部的工作，目前一般的事業單位很少有其他部門參與的，要求事業單位各個部門協同、討論、研究、琢磨最後才能編織出行之有效的預算編制。事業單位雖然意識到預算編制很重要，是整個預算管理的開始，並且進行論證研討，各個部門分工合作制定出了看似完美的預算編制，但是由於資料錯亂、資料不真實，會在後續實行過程中與預算編制完全脫軌，導致預算不可控制。所以，預算編制的科學合理性與真實性相當重要，一定要加強對預算編制的正確認識。許多事業單位在日常工作中，缺乏對預算管理的有效監督、考核審查及評價的制度，事業單位的預算管理得需要對預算的執行力度、情況來進行分析，以便考核審查預算結果與實際結果是否一致，後期是否發生追加預算的情況，在分析實際結果與預算結果的差異，為以後工作打下良好基礎。完善的預算管理機制是管理規劃最最基本的，有些行政事業單位在制定好預算管理機制後缺乏有效的監督、考核審查及評價工作；只有建立起對預算管理行之有效的監督、考核審查及評價的機制，才能更快、更好、更高效的實行預算管理。
1.加強行政事業單位對預算管理的重視度加大力度嚴格執行預算管理提高事業單位負責人對預算管理的重視度，整個行政事業單位的.人員都要強化對預算管理的認識，並且積極配合執行；首先要按預算進行使用規劃，把有限的經費提高到最大的利用率，以輕重緩急合理的、靈活的安排資金，以保障事業單位正常執行。
2.提高預算編制的合理性與真實性科學編制預算內容，關鍵是要正確把握資產預算的編制依據。增量資產配置應當建立在存量資產的使用和利用上，因此，合理的預算編制依據應當充分考慮增量資產配置與存量資產使用情況的匹配關係，以增量資產啟用存量資產。預算編制部門主要做好兩項工作：一方面，預算編制部門要改變增量資產配置和存量資產使用無關的狀況，對行政事業單位的存量資產進行充分調研和分析，掌握包括各類資產的數量、分佈、使用和利用狀況等重要資訊；另一方面，預算編制部門要根據行政事業單位履行工作職能和事業發展的需要，確定單位各類資產的配置標準。最後，預算編制部門將存量資產使用狀況與資產配置標準進行合理匹配後，提出增量資產的配置方案。同時需要注意的是，預算編制要充分考慮各單位資產使用的績效評價結果。實踐中，行政事業單位的預算編制不能只以巨集觀狀況制定，更需要考慮各個方面的細節；預算編制一定要具有合理性、真實性，不能盲目的制定出預算編制，就開始執行，要經過企業各個部門的領導人開會研究討論，看是否是合理的真實的預算編制。
3.建立起對行政事業單位預算管理進行監督、考核審查及評價的機制監督、考核審查及評價行政事業單位預算管理的機制要積極快速的建立起來刻不容緩。
制定相關的規章制度，配備足夠的相關執行人員，對行政事業單位預算管理的監督、考核審查及評價起到有效作用。
總而言之言而總之，預算管理對行政事業單位的作用極大，隨著我國經濟不斷地飛速發展，行政事業單位必須要建立起完善的預算編制的部門，行之有效的監督機制，這樣行政事業單位才會在日益劇增的新經濟時代站穩腳。