一、事業單位內部會計控制現狀考察
從內部會計控制的發展來看，國外很早就開始理論研究並付諸於實踐。我國直至20世紀90年代中期才開始予以關注並逐步加強制度建設，目前企業內控制度體系已基本形成，相比之下，事業單位內控制度建設較為滯後。從實踐來看，雖然許多事業單位開始接受新的管理理念，實施內部會計控制，但由於多方面因素的影響，內部會計控制實施效果並不令人滿意，從總體上看，還存在不少突出問題。一是事業單位內部會計控制環境有待改善。控制環境影響內部人員實施控制的自覺性，決定會計控制能否正常發揮作用。當前，不少事業單位負責人對內部會計控制認識不足，對相關的政策理解不深入，甚至認為實施內控耗費大量人力物力，得不償失，積極性不高。而會計人員普遍素質不高，缺乏職業判斷能力、分析能力和職業敏感性，加上法律意識薄弱，監督管理責任意識不強，難以保證內部會計控制順利執行。二是內部會計控制制度不健全。事業單位由於內控制度建設落後，缺乏權威的指引，造成單位在制度設計上不盡合理，缺乏系統性、科學性、可操作性，以致實際工作中隨意性較大，控制力不強。三是資訊交流與溝通系統不完善。完善的資訊系統不僅有助於管理層及時獲得、掌握內部會計控制活動的相關資訊，還能增強與職工的溝通，使職工順利履行其職責。事業單位在此方面尚需要完善。四是內部會計控制監督評價機制缺失。內部會計控制是一個過程，對其進行監督評價是必要的，這有助於內部會計控制合理、合法執行，達到預設目標。但事業單位多未設定專門的內部會計控制評價機構，對內控制度的合理性及執行情況進行檢查和評價。
二、加強事業單位內部會計控制的相關措施
（一）改善事業單位內部會計控制環境
控制環境是事業單位構建內部會計控制體系的.基石，單位領導要與時俱進，更新管理理念，改變過去重事業發展、輕內控管理的思想，將內部會計控制作為一項關係事業發展的大事來抓，加強內控宣傳，為單位內部會計控制的實施提供必要支援，並以身作則，帶頭遵守有關規定，促進單位形成重視內控管理的新風氣。會計人員作為內部會計控制的關鍵要素，其素質對內部會計控制的成效深具影響。事業單位應加強會計繼續教育，全面提升會計人員素質，確保其在內部會計控制活動中能夠發揮應有作用，不僅能嚴格遵守核算制度，提供高質量會計資訊，而且能忠實履行監督職能，對事業單位的各項經濟業務活動實施嚴格監督。
（二）健全內部會計控制制度
事業單位應在國家內控法規的要求及財政部門的指導下，結合本單位實際，構建一套科學合理、實用性強的內部會計控制制度。該制度的設計應遵循合法性、全面性、系統性、制衡性、適應性等原則，做到單位領導和各職能部門的職權和責任明確，各項經濟業務處理應遵守的程式和手續明確，保證各崗位、人員之間能夠形成監督制約關係，並將各項制度貫徹落實到位，責任落實到人，避免制度流於形式。
（三）完善資訊交流與溝通系統
這是建立與實施內部會計控制的重要條件。為提高會計控制效率，事業單位需要建立快速順暢的資訊傳遞機制，一方面，要加強單位會計資訊化建設，推動部門之間資訊共享和資訊流動，確保內部會計控制各環節之間持續不斷的資訊交流，使內控中的風險和缺陷及時反饋到管理層和各職能部門。另一方面，要建立有效的職工溝通渠道，鼓勵廣大職工發表意見，反映問題，消除內控隱患。
（四）加強內部會計控制監督評價
這一工作多由內部審計承擔。事業單位要重視內部審計建設，不僅要加強內審機構及內審隊伍建設，更要放開權利，賦予內審部門較大的監察許可權，對單位內部會計控制活動進行有力監督，並進行客觀評價，發現內部會計控制制度的設計缺陷及執行中暴露出的問題，提出整改意見，促進事業單位內部會計控制的完善。