當前很多單位習慣根據工作中積累管理經驗，來建立自身內部的控制制度，儘管在工作實踐中也陸續形成了一些管理辦法、條例、暫行規定等模式，但這些辦法已經很難適應現代財務管理的要求。因此在個別單位逐漸暴露出單位內部會計控制方面質量低下，財務管理工作存在許多盲點和侷限性的問題，這些問題若不及時改進，勢必會影響到本單位業務的良性發展。
(一)造成單位內部會計控制低下的原因和現狀
1、內部會計控制制度不健全、不完善
內部會計控制制度是單位內部應用會計方法和其他有關方法，對財務、會計工作和有關經濟業務進行控制，使其形成相互聯絡、相互制約的一種管理制度。但是，目前很多單位都沒有建立起完善的內部會計控制制度，包括憑證、賬簿、報表的處理程式，會計檔案的保管，會計工作的交接，會計人員的崗位責任制等主要的內部會計控制制度都沒有完善，從而造成會計核算行為的隨意性和會計資訊的不可靠性。這種情況集中體現在中小型單位和“內部人控制”較嚴重的單位。在我國，大多數的單位的財務管理工作受人為干擾嚴重，單位領導多數對會計不太熟悉，也不太重視。所以，往往沒有內部會計控制，坐支、白條抵賬或者私設小金庫的現象屢見不鮮。在“內部人控制”較為嚴重的單位，領導或是利益相關者利用職權的便利控制整個業務及會計處理程式，以獲得最大的利益。
2、內部會計控制制度缺乏科學性和合理性，不利於制度的實施
在已建立內部會計控制制度的單位中，相當一部分單位的內部會計控制制度缺乏科學性和合理性，主要表現在：①脫離單位內部實際情況。部分單位脫離實際，建立的內部會計控制制度，照搬、照抄其他單位的內部會計控制制度，使內部會計控制制度無法適合單位的內部組織形式。②內部會計控制組織不健全或職責不清。在設計內部會計控制時，未達到縱橫交錯，點面結合的控制要求，制定的內部會計控制失控等情況時有發生，使內部會計控制制度無法正常實施。③忽視成本效益原則。部分單位在設計制度時，過於強調其嚴密性和完整性，為此增設機構、增加手續和程式，造成重複勞動，單位成本上升。
3、內部審計弱化，監督不力
單位內部會計控制是一個過程，這個過程是通過納入管理過程的大量制度及活動實現的。要確保單位內部會計控制的有效性，就必須對其實行監督。內部審計既是監督單位內部會計控制有效運轉的重要措施，也是單位內部會計控制的一個主要內容。但是在我國，內部審計機構往往成為單位內部虛設的一個機構，多是徒有虛名或名存實亡，沒有發揮出內部審計應有的功能，從而影響了單位內部會計控制質量和進一步的發展。
二、提高單位內部會計控制質量的措施
1、以會計法律法規為依據，科學、合理的建立內部會計控制制度
《會計法》和《內部會計控制規範》等會計法律、法規為各單位建立、健全內部會計控制制度指明瞭方向。各單位都應該在符合國家有關法律、法規的前提下，深入研究本單位的實際情況，因地制宜地制定本單位的內部會計控制制度。科學、合理的建立內部會計控制制度有以下幾個原則：①全面性原則。即單位內部會計控制制度必須從會計核算和會計監督的角度出發，將觸角滲透到單位各項業務過程和各個操做環節中，覆蓋所有的部門和崗位，不能留有死角。②系統性原則。在設計制度時，部門和崗位應形成既相互制約又縱橫交錯的關係，以保證制度能按照特定的目標發揮其功能。③內部牽制原則。這是內部會計控制制度的核心原則。④效益性原則。即在設計內部會計控制制度時，要以合理的控制成本達到最佳的控制效果。⑤職責明確原則。在建立內部會計控制制度的過程中，必須明確各部門及人員應承擔的責任範圍及許可權，明確規定操做規程和處理手續，確定追究、查處責任的措施與獎懲辦法等。
2、優化單位內部會計控制環境
單位內部會計控制的環境主要指對單位內部會計控制構成直接影響的各種因素，包括單位管理班子的建立、領導及員工的素質、單位的文化氛圍等，它們直接影響單位內部會計控制的建立、完善及有效實施。①強化以人為本的觀念，建立新型管理關係。單位內部會計控制要強化以人為本的理念，強調溝通和感情的交流，消除管理者與被管理者之間的隔膜，形成強有力的群體，調動員工的積極性。②加大宣傳力度，提高全員綜合素質。
3、建立預算控制
預算控制是現代單位會計控制的一種主要方式，單位通過預算控制，能使單位的經營目標轉化為各部門、各個崗位以致個人的具體行為目標作為各受控單位的約束條件，從根本上保證單位經營目標的實現。編制預算的過程就是對單位經營目標的進一步分解，因此，其本身具有可控性和可考核性，單位管理者可以根據預算所確定的標準進行控制，評定工作成效，找出偏差，進而採取糾正措施消除偏差。此外，預算控制的重要意義還在於它能改善協調和加強控制。當單位的各個職能部門都編制了預算時，就為協調單位各部門的活動奠定了基礎;同時，由於預算結果的偏離將更容易被查明和評定，預算也為控制過程的`糾正措施提供了基礎。
4、建立責任會計控制系統
結合我國當前的社會形勢，增設責任會計無疑是我國單位對內加強過程控制實現目標管理，對外增強單位競爭力的一種有效管理方式。責任會計控制系統作為會計控制系統中極為重要的一個模組，一方面擔負會計事中控制的重任，另一方面又作為連線預算控制系統和控制評價系統的橋樑，使得整個會計控制系統形成一個閉環控制迴路。更為重要的是，責任會計控制系統與單位業務和其他管理系統緊密相連，形成開放式的控制環境，與單位業務流程做到高度集中化。
5、採取薪金優厚與違法嚴懲相結合的內部激勵機制，加強內部會計控制執行力度
鑑於會計人員專業素質要求較高、承擔的社會責任較重大，而會計中的主觀估計、判斷、會計政策的可選擇性及厲害關係者的人為干擾，因而，從對會計人員賦以高薪待遇，其獎金與工作質量掛鉤，以促使發揮積極性、創造性。對會計資訊虛假的會計人員，除按有關規定處罰外，對會計人員按造成的有關損失的檔次進行經濟處罰，罰金由個人收入或由職業協會風險基金支付，不得列作單位費用，嚴重的按刑法論處等。
總之各級財政部門應當認真履行《會計法》等相關法律、法規賦予的相關責任，深入開展檢查，加強外部監督，從而遏制單位內部會計控制行為事項的發生，對不認真建立和實施內部會計控制的單位加大處罰力度，並建立起有效的單位違法行為追究機制，增強威懾力，確保內部會計控制的質量和效果。