最近幾年，伴隨社會經濟的不斷進步，強化會計內部控制制度是企業的重要道路。會計內部控制制度對確保會計資料的準確性、維護企業的合法性、減少企業的經營風險、為企業發展目標提供保證有著極為重要的意義。企業會計內部控制制度與企業能否適應社會經濟激烈的競爭有著極大的關係，還變成了評定企業管理方面水平高低的標準。
一、 企業內部控制普遍存在的缺陷
(一)企業內部控制監控力度不夠
現今，雖然大部分的企業都已經有會計監控體系，但是還沒有達到理想的的效果以及其自身的作用，無法及時對會計決策、會計行為以及會計人員進行有效的控制與監督，在企業內部普遍存在輕經營、重視生產，輕管理、重視開發等方面比較傳統的思想，大部分的企業沒有重視會計內部控制制度的監控體系，在企業內部還沒有構建相關的崗位責任制度，沒有規範相關人員與組織主要的責任與權利，造成員工責任與權利不明確，企業僅僅只是在會計制度的表面做到預防、控制以及監督等工作。比如說，有些企業沒有在內部建立會計審計的相關機構，或者是已經建立了但是該審計機構的作用由於企業領導不重視沒有得到充分的發揮。
(二)員工的整體素質有待加強
隨著市場經濟的不斷進步，對會計人員的需求也越來越大，從事會計行業的人員也逐漸變多，但是在會計行業中還是有部分存在著職業道德與業務能力比較落後的工作人員，在會計行業中極度缺乏整體素質較高的會計工作人員，這種現象造成了企業會計內部控制制度的構建、實施以及執行在很大程度上受到限制，不能對企業會計內部控制制度的實行起到幫助的作用，無法提供給企業全面的會計資訊，這給企業財務內部控制帶來了很大的挑戰，使會計本身的功能及作用受到了一定的影響。
(三)沒有充分認識會計內部控制制度
根據很多資料顯示，目前部分企業的主要負責人沒有充分認識到會計內部管理制度的重要，這就無法確保在企業能夠執行與貫徹會計內部控制制度。其中主要體現在以下幾個方面：我國部分中型小型的企業目前沒有對會計內部控制制度進行有效的管理;部分企業雖然以及構建會計內部控制制度，但是制度還未健全，不能對企業的財務進行可行性、操作性、系統性的管理;部分企業僅僅是在表面上實行會計內部控制制度，沒有實際的去貫徹或執行，特別體現在企業的財務出現困難或者問題的時候，就顯得缺少靈活性或者沒有相關的規定來解決。以上所描述的幾個方面問題都和企業的領導沒有充分認識會計內部控制制度有比較大的關聯，因此讓會計工作在企業的'財務管理中失去了原有的剛性與嚴肅性。
(四)會計資訊化構建比較落後
隨著計算機技術資訊化的不斷進步，推動企業會計行業出現了嶄新的變化，會計電算化、管理客戶關係、資訊管理系統、規劃企業資源、虛擬化企業、電子商務等各種資訊化的應用逐漸出現，計算機資訊化在很大程度上推動了企業在管理要點、組織形式、管理體制等不同方面快速進步。這種發展方向使企業會計內部控制制度面臨著更大的挑戰，企業要觀察市場經濟的具體發展情況，及時調整與變化企業原先構建的會計內部控制制度。但是由於部分企業在構建會計計算機資訊化使比較落後，沒有充分的瞭解和會計工作有關的計算機資訊化技術，造成了企業無法使用計算機資訊化技術對會計工作進行管理，經常會出現審計延遲以及洩露企業會計資訊等情況，在很大的程度上制約會計工作的正常執行。
二、完善企業會計內部控制的措施
(一)構建健全的會計內部控制制度
企業會計內部控制制度在具體實施的過程中要非常重視，企業會計內部控制制度的好壞會給企業經濟發展帶來一定的影響。所以，企業在實施過程中要堅持成本與利益互相配合的基本原則，站在企業實際的經營、生產以及管理方面思考企業未來的發展，不斷的完善與構建企業內部會計控制制度。在具體的執行過程中，要確定企業負責人的主要責任與企業每個管理部門的主要責任及權利，特別是要認真的處理企業內其他部門與財務管理部門之間的關係。因此，企業要重視完善會計內部控制制度，構建健全的財務管理制度。比如：企業資金管理、企業企業固定資產管理、企業無形資產管理以及企業對外借帳等相關制度。
(二)加強企業員工的培訓與教育
在企業的發展道路上，員工是發展中最重要的因素。構建再好的管理制度都是要有員工去實行，不然無法將制度的作用充分發揮。根據分析企業目前會計工作人員的綜合素質，在日常的工作中不斷加強會計工作人員的培訓以及教育是非常重要的。首先，一定要嚴格控制會計工作人員的錄用情況，堅決不錄用那些沒有得到會計相關證書的工作人員，確保企業會計內控部門的工作人員在進入企業時技能水平及業務能力在同一層次上。其次，在工作過程中，企業要強化財務管理人員的培訓及教育，不斷提高財務管理人員對會計內控制度與責任的認識，使會計工作人員的知識水平得到豐富，增強管理會計工作的能力，使會計工作人員養成平易近人、廉潔奉公的良好職業道德。再次，企業要制定健全的培訓基層工作人員的計劃，把培養員工良好的職業道德以及基本業務水平當成培訓的主要目的，不斷提高會計工作人員的質量與工作效率。
(三)構建財務有效的執行機制
為了能讓企業價值最大化的實現，企業要極度重視財務管理機構的建立，在實際的工作過程中，要將財務管理視為重點，構建財務有效的執行機制。以往相對老舊的會計工作，主要就是進行一些簡單的數字統計，記錄企業在經營生產的活動中獲得的經濟效益以及執行的資本，準確的通過簡單的資料形式反映。但是傳統的會計工作模式已經無法與新形勢下企業快速發展與生存的需求互相適應，因此，企業的財務管理責任與會計工作需要深入的擴大機豐富。根據內部控制制度的相關規定，企業要結合自身的會計工作需求與業務特徵進行構建符合自身發展的內部機構，明確與落實企業員工的權利與責任，
(四)提高企業管理與監督力度
企業不斷提高內部管理與監督力度，是建立健全企業會計內部控制制度不能缺少的過程與重點。特別體現在新形勢下企業的會計工作，企業會計管理部門要制定詳細的工作規章制度規範員工的工作行為，制定健全的工作評價考核制度。為了避免會計部門相關工作人員傷害公司利益的情況出現，在完善健全的會計內部控制制度的基礎上要制定相關的監控體系，加大監控力度。所以，企業要確定每個工作人員的責任，嚴格控制會計工作人員的義務與權力，通過制定相關的獎勵與懲罰制度，有效的的會計工作人員的工作進行制約。