內部牽制制度規定了涉及企業款項和財物收付、結算及登記的任何一項工作，必須由兩人或兩人以上分工處理，以起到一種相互制約的作用。例如：出納人員不得兼任稽核、會計檔案保管和收入、支出、費用、債權債務賬目的登記工作，即“管賬不管錢，管錢不管賬”。通過內部稽核制度和牽制制度的建立，既能夠保證各種會計核算資料的真實、合法和完整，又能使各職能部門的經辦人員之間形成一種相互牽制的機制。
內部審計是實施再監督的一種有效的手段
其目的是為了健全中小企業的內部控制制度，嚴肅財經紀律，查錯防弊，改善經營管理，保證中小企業持續健康的發展，提高經濟效益。在建立內部審計制度時，要堅持內部審計機構與財務機構分別獨立的原則，同時要保證內審人員獨立於被審計部門，只有這樣才能更好地實施會計的再監督作用。
建立財務審批許可權和簽字組合制度
中小企業建立財務審批許可權和簽字組合制度的目的在於加強企業各項支出的管理，體現財務管理的嚴格控制和規範運作。在審批程式中規定財務上的`每一筆支出應按規定的順序進行審批；在簽字組合中規範了每一筆支出的單據應根據審批程式和審批許可權完成必要的簽名，同時還應規定出納只執行完成簽字組合的業務，對於沒有完成簽字組合的業務支出，出納員應拒絕執行。小企業通過建立財務審批許可權私簽字組合制度，對控制不合理支出的發生及保證支出的合法性能起到積極的作用。
建立成本核算和財務會計的分析制度
成本核算制度的主要內容包括成本核算的物件、成本核算的方法和程式以及成本分析等。特別要提出的是成本分析是財務會計人員的一項重要職責，企業的經營者必須定期瞭解企業的資金狀況和現金流量。企業財會人員也要定期向管理當局提供成本費用方面的各種報表，以利於經營者進行成本分析、成本控制和效益衡量。中小企業通過財務會計分析制度的建立，確定財務會計分析的主要內容、財務會計分析的基本要求和組織程式、財務會計分析的方法和財務會計分析報告的編寫要求等，使企業掌握各項財務計劃和財務指標的完成情況，檢查國家財經制度、法令的執行情況，有利於改善財務預測、財務計劃工作，研究和掌握企業財務會計活動的規律性，不斷改進財務會計工作。
規範會計基礎工作，提高會計工作的水平
在市場經濟條件下，中小企業的管理者應更好地認識到會計服務主體、核算範圍，以及資訊質量的新特點。會計工作要滿足各類投資者、債權人及國家巨集觀管理部門的需要，由於會計工作不僅影響到企業與國家的分配關係，亦影響到社會各方面的利益關係，因而企業應將協調各方面的利益關係、抵制和防範各種市場風險作為其基點，使會計資訊能夠真實公允地反映企業資金的運轉情況、經濟效益的提高情況及企業的發展前景。企業應從保證國民經濟高效執行、促進社會主義市場經濟健康發展的角度，使中小企業的管理者提高對會計核算和財務管理重要性的認識，從而充分意識到會計這一基礎工作的重要意義。同時以財政部頒佈的《會計基礎工作規範》為依據，健全中小企業的會計基礎工作，提高其會計工作水平。