一、企業所得稅納稅籌劃中存在的問題：
(一)稅收制度不夠完善
對於任何專案來說，如果制度不完善，都會出現很多的問題。我國的企業所得稅納稅籌劃也是如此。我國政府對於企業所得稅納稅籌劃的制度不夠細緻，我國現行稅法體系有按稅種設立的稅收實體法和稅收徵管法等構成，單行法地位平行、排列鬆散，影響了稅法的整體效力。
(二)納稅籌劃風險不夠細緻
從當前我國納稅籌劃的實際情況看，納稅人在進行納稅籌劃過程中都普遍認為，只要進行納稅籌劃就可以減輕納稅負擔，增加自身收益，而很少甚至根本不考慮納稅籌劃的風險。其實，納稅籌劃作為一種計劃決策方法，本身也是有風險的。首先，納稅籌劃具有主觀性。其次，納稅籌劃存在著徵納雙方的認定差異。也就是說，即使是合法的納稅籌劃行為，結果也可能因稅務行政執法偏差而導致納稅籌劃方案行不通。
(三)涉稅人員水平不高
企業所得稅納稅籌劃在我國起步較晚，對於目前來說，還沒有專業的稅務籌劃師、稅務精算師等專業隊伍，這嚴重影響了我國的納稅籌劃工作，同時，涉稅人員水平距離已開發國家還有較大的距離。
二、提高企業所得稅納稅籌劃的策略
針對以上問題：得出了以下提高企業所得稅納稅籌劃的策略方法：
(一)強化管理，規範行為
加強管理，規範行為是企業進行一切事物的重要環節。納稅籌劃也不例外。只有加強管理，規範行為，將會計資料規範整齊，資料齊全，才能更加廣泛的進行納稅籌劃，才能降低納稅籌劃的成本。同時，必須在稅法規定並且合法的前提下進行籌劃，才更加有利於納稅籌劃工作。
(二)規避納稅籌劃的.風險
規避納稅籌劃的風險要做到以下幾點：
第一：研究掌握法律規定和充分領會立法精神，準確把握納稅政策內涵;
第二：充分了解當地稅務徵管的特點和具體要求，使納稅籌劃行為能得到當地稅務機關的認可;
第三：聘請納稅籌劃專家，提高納稅籌劃的權威性和可靠性。因此，對於那些綜合性的、與企業全域性關係較大的納稅籌劃業務，最好還是聘請納稅籌劃專業人士(如註冊稅務師)來進行，從而進一步降低納稅籌劃的風險。
(三)定期培訓稅收籌劃人才
企業所得稅稅收籌劃是一個高層次的理財活動，高素質的人才是其成功的首要條件。原因在於：
(1)稅收籌劃人員要精通國家稅法及會計法規，並時刻關注其變化;
(2)稅收籌劃人員要了解企業的外部市場、法律環境等等，同時熟悉企業自身的經營狀況;
(3)稅收籌劃還必須具有一定的實際業務操作水平。因此，要不斷的加強企業所得稅納稅籌劃人的水平，定期進行培訓工作，對於一些籌劃方面的新知識能夠做到儘快掌握。